Nøgleforskellen mellem dATP og ddATP er, at dATP ikke afslutter DNA-syntese, mens ddATP er i stand til at afslutte DNA-syntese. Dette skyldes, at ddATP har et H-atom knyttet til 3ʹ-stillingen af pentosesukkeret, mens dATP har en OH-gruppe knyttet til 3ʹ-stillingen.
dNTP'er er byggesten i DNA. Der er fire typer af dNTP'er ifølge purin- eller pyrimidinbaserne - dATP en af dem. Den nitrogenholdige base af dATP er adenosin. ddNTP'er er nukleotider, der bruges i Sanger-sekventering. Der er fire typer ddNTP'er. ddATP er en ddNTPs.
Hvad er dATP?
Deoxyadenosintriphosphat er et nukleotid, som er en byggesten i DNA. DNA-polymeraseenzym bruger dATP som et substrat for DNA-syntese. dATP har tre komponenter: et deoxyribose-sukkermolekyle, et adenosin og de tre fosfatgrupper. Derfor er det et purin-nukleosidtrifosfat. Den kemiske formel for dATP er C10H16N5O12 P3, og dens molekylmasse er 491.182.
Figur 01: dATP
dATP adskiller sig fra ATP (adenosintrifosfat) med hensyn til sukkerkomponenter. ATP har ribosesukker. dATP basepar med uracilnukleotid under transkription. Ud over at deltage i DNA-syntese kan dATP fungere som et energioverførende molekyle for også at opretholde cellelevedygtighed. Et højt niveau af dATP i kroppen er giftigt, da det kan fungere som en ikke-konkurrerende hæmmer for enzymet ribonukleotidreduktase. Det kan føre til nedsat immunforsvar.
Hvad er ddATP?
Dideoxyadenosintriphoaphate eller ddATP er en af de fire typer nukleotider, der bruges i Sanger-sekventeringsmetoden. Strukturelt har ddATP også tre komponenter, der ligner dATP. De er en adeninbase, et deoxyribosesukker og tre fosfater.
Figur 02: ddATP
I modsætning til dATP mangler ddATP en OH-gruppe i 3'-positionen af pentosesukkeret for at danne phosphodiesterbinding med det tilstødende nukleotid og fortsætte kædeforlængelsen. Det har et H-atom i 3' position. Derfor, når ddATP er inkorporeret, slutter DNA-syntesen. Det er det grundlæggende princip i Sanger-sekventering. Derfor virker ddATP som en kædeforlængelsehæmmer i Sanger-sekventering. Der bruges fire rør i Sanger-sekventering, og ddATP føjes til et rør.
Hvad er lighederne mellem dATP og ddATP?
- dATP og ddATP er nukleotider.
- Begge er sammensat af adenin, deoxyribose og tre fosfater.
- De er organiske forbindelser.
- Både dATP og ddATP tilføjes til rør i Sanger-sekventering.
Hvad er forskellen mellem dATP og ddATP?
dATP har en OH-gruppe i 3'-stillingen af pentosesukkeret, mens ddATP mangler en OH-gruppe i 3'-stillingen af pentosesukkeret. Ydermere er dATP en monomer, der bruges i DNA-syntese, mens ddATP bruges til at afslutte kædeforlængelse under Sanger-sekventeringen. Så dette er den vigtigste forskel mellem dATP og ddATP. Desuden kan dATP danne phosphodiester-bindinger, mens ddATP ikke kan danne phosphodiester-bindinger.
Infografikken nedenfor viser flere forskelle mellem dATP og ddATP i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – dATP vs ddATP
Kort fort alt er dATP en forløber for DNA-syntese, mens ddATP er et nukleotid, der bruges til at afslutte DNA-syntese i Sanger-sekventering. Desuden har dATP en OH-gruppe i 3'-stillingen af pentosesukker, og det tillader dannelsen af en phosphodiesterbinding med det næste nukleotid. I mellemtiden mangler ddATP OH-gruppe i 3'-position; derfor er den ikke i stand til at danne en phosphodiesterbinding med det næste nukleotid. Som et resultat ophører DNA-sekvensen med sin forlængelse. Dette opsummerer således forskellen mellem dATP og ddATP.
