Nøgleforskel – gentagne DNA vs satellit-DNA
Genomisk DNA er hovedsageligt sammensat af kodende DNA og ikke-kodende DNA. Kodende sekvenser er kendt som gener. Tusindvis af gener er placeret på kromosomer. Gentagende DNA, introner og regulatoriske sekvenser betragtes som ikke-kodende DNA i genomet. Repetitivt DNA er nukleotidsekvenserne, der gentages igen og igen i organismernes genom. Repetitivt DNA tegner sig for en betydelig brøkdel af genomisk DNA og er kategoriseret i tre hovedtyper kaldet tandemgentagelser, terminale gentagelser og indskudte gentagelser. Tandem-gentagelser er meget gentagne i genomet. En type tandem-gentagelser er satellit-DNA. Den vigtigste forskel mellem gentagne DNA og satellit-DNA er, at repetitivt DNA er de gentagne sekvenser af DNA i genomet, mens satellit-DNA er en type gentagne DNA, som er meget gentaget og for det meste placeret i den heterokromatiske region omkring centromeren.
Hvad er repetitivt DNA?
Repetitivt DNA har gentagne nukleotidsekvenser igen og igen. Repetitivt DNA er også kendt som gentagne elementer eller gentagelser. Gentagende DNA optager en betydelig brøkdel af det samlede genom hos mange organismer. Det menneskelige genom indeholder mere end en to-tredjedels sekvens af gentagne DNA. Disse koder ikke for proteiner og tilhører kategorien af ikke-kodende DNA i genomet.
Der er tre hovedtyper af gentagne DNA kaldet terminale gentagelser, tandem-gentagelser og indskudte gentagelser. Tandemgentagelser er de meget gentagne sekvenser, som ligger ved siden af hinanden. Der er tre typer tandem-gentagelser kaldet satellit-DNA, minisatellit-DNA og mikrosatellit-DNA. Interspersed repetitive DNA er repetitive sekvenser spredt gennem genomet som enkelte enheder med unikke flankerende sekvenser. Der er to typer indskudt DNA kaldet transposoner og retrotransposoner. De opstår på grund af evnen til transposition i genomet. Retrotransposoner hører til klasse 1-transposerbare elementer og følger copy and paste-mekanisme for at integreres i genomet. Transposoner tilhører klasse 2 transposerbare elementer, da de følger cut and paste-mekanismen for at bevæge sig langs genomet.
Selvom gentagne DNA ikke er kodet for proteiner, er de vigtige for forskellige funktioner i genomet. Repetitivt DNA er essentielt for at formatere ekspression af unikke kodende sekvenser og for at tilvejebringe yderligere funktioner, der er nødvendige for genomreplikation og nøjagtig transmission til datterceller osv. Repetitivt DNA tilvejebringer også en betydelig brøkdel af stillads- eller matrixtilknytningsregioner, hvilket viser dets nødvendighed for at organisere genomet af organismer.
Hvad er satellit-DNA?
Satellit-DNA er en type gentaget DNA, som er meget gentaget. De tilhører kategorien af gentagne DNA kaldet tandem gentagelser. Satellit-DNA gentages tandem og lokaliseres i centromer- og telomerregionerne af kromosomerne. En kort gentagne enhed af satellit-DNA varierer fra 5 til 300 basepar, afhængigt af arten. De gentages norm alt 105 til 106 gange i genomet. I pattedyrs genom tegner satellit-DNA sig for 10-20 % fraktion.
Satellit-DNA koder ikke for proteiner og formidler ikke funktionel genetisk information. De bidrager til den kromosomale organisation, da de tjener hovedkomponenten i de funktionelle centromerer og som den vigtigste strukturelle bestanddel af heterochromatin.
Satellit-DNA adskiller sig i tæthed med størstedelen af DNA. Derfor giver det et separat bånd under ultracentrifugering. Der er forskellige typer satellit-DNA kendt som alphoid DNA, beta, satellit 1, satellit 2, satellit 3 osv.
Figur 01: Gentagende DNA og satellit-DNA
Hvad er forskellen mellem repetitivt DNA og satellit-DNA?
Repetitivt DNA vs satellit-DNA |
|
Repetitivt DNA er de nukleotidsekvenser, der gentages mange gange i organismers genom. | Satellit-DNA er én type gentaget DNA, der gentages millioner af gange i genomet. |
Typer | |
Der er tre hovedtyper såsom terminale gentagelser, tandem-gentagelser og indskudte gentagelser. | Satellit-DNA er klassificeret i forskellige typer såsom alphoid, beta, saterllite1, 2 og 3 osv. |
Location | |
Repetitivt DNA er placeret i hele genomet. | Satellit-DNA er placeret i centromer- og telomerregioner af kromosomet. |
Opsummering – gentagne DNA vs satellit-DNA
Genomer er organiseret i forskellige typer DNA. Kodende sekvenser blandt dem er lagret med genetisk information for at syntetisere proteiner. Andre ikke-kodende sekvenser tilvejebringer strukturelle og yderligere funktioner til DNA-replikation, kromosomstrukturvedligeholdelse osv. Repetitivt DNA er en type ikke-kodende DNA, som gentages igen og igen i genomet. Gentagende DNA har forskellige typer og satellit-DNA, som er placeret i centromer- og telomerregionerne af kromosomerne, er en type af dem. Dette er forskellen mellem gentaget DNA og satellit-DNA.
Download PDF-version af repetitivt DNA vs satellit-DNA
Du kan downloade PDF-versionen af denne artikel og bruge den til offline-formål i henhold til citatnoter. Download venligst PDF-version her Forskel mellem gentagen DNA og satellit-DNA – PDF.