Nøgleforskellen mellem isoskizomerer og isocaudomerer er, at isoschizomerer genkender og sp alter det samme restriktions- eller genkendelsessted, mens isocaudomerer genkender lidt forskellige restriktionssteder og sp alter på det samme sted.
Restriktionsenzymer eller restriktionsendonukleaser er en type nukleaser, der sp alter dobbeltstrenget DNA. De er i stand til at genkende specifikke sekvenser kaldet restriktionssteder, som er palindromiske i oprindelse. Bakterier producerer restriktionsenzymer mod fremmede patogener, især mod vira. Det er en form for forsvarsmekanisme vist af bakterier. Afhængigt af strukturen af enzymet og arten af udskæringer er der tre typer restriktionsenzymer som type I restriktionsenzymer, type II restriktionsenzymer og type II restriktionsenzymer. Afhængigt af den biokemiske aktivitet og kilden til isolation er der desuden tre typer restriktionsenzymer som isoskizomerer, neoskizomerer og isocaudomerer.
Hvad er isoskizomerer?
Isoskizomerer er en type restriktionsenzym, der kommer fra forskellige kilder, men som genkender og sp alter det samme restriktionssted i DNA. Derfor har to isoskizomerer det samme genkendelsessted. De sp alter på det samme sted, så de er specifikke for den samme genkendelsessekvens. For eksempel er restriktionsenzymer SphI og BbuI to isoskizomerer, der genkender og sp alter ved CGTAC/G.
Figur 01: Restriktionsenzym
Et andet par isoskizomerer er HpaII og MspI. De genkender begge sekvensen 5′-CCGG-3′ og sp alter DNA'et. Desuden er Bsp EI og Acc III også isoschizomerer, der er fra henholdsvis en Bacillus-art og Acinetobacter calcoaceticus. Isolering af isoskizomerer kan udføres fra forskellige bakterier. Da de kommer fra forskellige bakterier, kan deres restriktionsbetingelser være forskellige fra hinanden.
Hvad er isocaudomere?
Isocaudomerer er en type restriktionsenzym, der genkender lidt forskellige sekvenser, men de sp alter på det samme sted for at producere de samme ender. Isocaudomerer kommer også fra forskellige bakterier. Sau3a og BamHI er et par isocaudomerer. De producerer 5'-GATC-3' klæbrig ende efter sp altning af det samme sted. Et andet par isocaudomerer er NcoI fra Nocardia corallina og PagI fra Pseudomonas alcaligenes. Disse to enzymer binder også ved forskellige genkendelsessekvenser, men skærer på det samme sted og producerer de samme klæbrige ender. Derfor er producerende skæreender kompatible med hinanden, og de kan ligeres til hinanden. XhoI, PspXI og SalI er også isocaudomerer.
Hvad er lighederne mellem isoskizomere og isocaudomere?
- Isoskizomerer og isocaudomerer er to typer restriktionsenzymer.
- To isoskizomerer har det samme fordøjelsessted, svarende til to isocaudomerer, der har det samme fordøjelsessted.
- De er prokaryote af oprindelse.
- Begge har et begrænsningsgenkendelsessted såvel som et fordøjelsessted.
- De producerer ender, der er kompatible med hinanden.
- Desuden er disse enzymer nyttige værktøjer i rekombinant DNA-teknologi.
Hvad er forskellen mellem isoskizomere og isocaudomere?
Isoschizomerer er restriktionsenzymer, der genkender den samme DNA-sekvens og sp alter på det samme restriktionssted, mens isocaudomerer er restriktionsenzymer, der genkender lidt forskellige DNA-sekvenser, men producerer de samme klæbrige ender ved at skære på det samme sted. Så dette er den vigtigste forskel mellem isoskizomerer og isocaudomerer.
Nedenstående infografik viser forskellen mellem isoschizomere og isocaudomere.
Opsummering – Isoskizomers vs Isocaudomers
Isoskizomerer er restriktionsenzymer, der genkender den samme DNA-sekvens og sp alter på det samme sted. På den anden side er isocaudomerer restriktionsenzymer, der genkender de lidt forskellige sekvenser og sp alter på det samme sted og producerer de samme ender. Dette er således den vigtigste forskel mellem isoschizomerer og isocaudomerer. Sphl, BbuI, HpaII og MspI er flere eksempler på isoschizomerer, mens Sau3a og BamHI er to eksempler på isocaudomerer. Både isoskizomerer og isocaudomerer produceres naturligt af bakterier.
