Nøgleforskellen mellem isoskizomerer og neoskizomerer er, at isoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens og sp alter DNA'et i de samme positioner, mens neoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens, men sp alter DNA i forskellige positioner.
Restriktionsenzymer eller restriktionsendonukleaser er enzymer, der sp alter DNA i fragmenter ved eller nær specifikke genkendelsessteder. De skærer DNA på restriktionssteder. Restriktionsenzymer klassificeres norm alt i fem grupper baseret på struktur, om de skærer deres DNA-substrat på deres genkendelsessted, og om genkendelses- og sp altningsstederne er adskilt fra hinanden. Mere end 3600 restriktionsendonukleaser er allerede blevet identificeret. Ca. 800 restriktionsenzymer er kommercielt tilgængelige. Isoskizomerer og neoskizomerer er to typer restriktionsenzymer baseret på genkendelsessted og sp altningsspecificitet.
Hvad er isoskizomerer?
Isoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens og sp alter DNA'et i de samme positioner. Disse restriktionsenzymer har samme specificitet. Det første opdagede restriktionsenzym, der genkender en given sekvens, er kendt som en prototype, mens alle efterfølgende identificerede restriktionsenzymer, der genkender den samme sekvens, kaldes isoschizomerer. Imidlertid kan isoschizomerer afvige i stedpræferencer, reaktionsbetingelser, methyleringsfølsomhed og stjerneaktivitet. Isoskizomerer er isoleret fra forskellige bakteriestammer. Derfor kan de kræve forskellige reaktionsbetingelser. I nogle tilfælde kan kun én ud af et par isoschizomerer genkende både methylerede og ikke-methylerede former for restriktionssteder. På den anden side kan det andet restriktionsenzym kun genkende den umethylerede form af restriktionsstedet. Denne særlige egenskab ved isoskizomerer hjælper med at identificere restriktionsstedets methyleringstilstand, mens den isoleres fra en bakteriel tilstand.
For eksempel genkender og sp alter AgeI og BshT1 5'-A↓CCGGT i det samme mønster. HpaII og MSPI er andre par af isoskizomerer. De genkender begge sekvens 5'-C↓CGG-3', når den er umethyleret. Men når det andet C i sekvensen er methyleret, kan kun MSPI genkende denne sekvens, mens HpaII ikke kan genkende den.
Hvad er neoskizomerer?
Neoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens, men som sp alter DNA i forskellige positioner. I nogle specielle molekylærbiologiske anvendelser er dette en meget nyttig funktion. Neoskizomererne er en undergruppe af isoskizomerer. Velkendte eksempler på neoskizomerer er SmaI (5'-CCC↓GGG-3') og XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); begge genkender 5'-CCCGGG-3'-sekvensen, men sp alter dem i en anden position. Disse to restriktionsenzymer genererer således forskellige typer ender. I dette tilfælde producerer SmaI stumpe ender, og XmaI producerer 5' udragende ender.
Figur 01: Neoskizomers
Et andet eksempel er MaeII- og Tail-restriktionsenzympar. Prototype MaeII (A↓CGT) producerer DNA-fragmenter med en 2-base 5'-forlængelse, og neoschizomer Tail (ACGT↓) producerer DNA-fragmenter med en 4-base3'-udvidelse.
Hvad er lighederne mellem isoskizomere og neoskizomere?
- Isoskizomerer og neoskizomerer er to typer restriktionsenzymer.
- De findes overvejende i prokaryoter.
- De er en del af restriktionsmodifikationssystemet (RM) fundet i bakterier og arkæer.
- Begge er proteinmolekyler.
- Begge sp alter DNA i fragmenter.
Hvad er forskellen mellem isoskizomere og neoskizomere?
Isoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens og sp alter DNA'et i de samme positioner, mens neoskizomerer er restriktionsenzymer, der har den samme genkendelsessekvens, men som sp alter DNA i forskellige positioner. Så dette er den vigtigste forskel mellem isoskizomerer og neoskizomerer. Ydermere har isoskizomerer de samme specificiteter, mens neoskizomerer har forskellige specificiteter.
Den følgende infografik viser forskellene mellem isoskizomere og neoschizomere i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Isoskizomers vs Neoschizomers
Restriktionsenzymer er DNA-skærende enzymer. De kaldes også molekylære sakse. Der er forskellige typer restriktionsenzymer. Baseret på genkendelsesstedet og sp altningsspecificiteten er restriktionsenzymer to typer som isoschizomerer og neoschizomerer. Isoskizomerer har den samme genkendelsessekvens og sp alter DNA'et i de samme positioner, mens neoschizomerer har den samme genkendelsessekvens, men sp alter DNA i forskellige positioner. Dette er således den vigtigste forskel mellem isoskizomerer og neoskizomerer.
