Nøgleforskellen mellem gen-knockout og knockdown er, at gen-knockout er en teknik, hvor genet af interesse fjernes fuldstændigt (inoperativ tilstand) for at studere genets funktioner, mens gen-knockdown er en anden teknik, hvor genet af interesse forstummes for at undersøge det særlige gens rolle i et biologisk system.
Forskellige genetiske teknikker er i drift for at undersøge genernes funktion i de levende biologiske systemer. Gen-knockout og knockdown er to sådanne teknikker. Disse teknikker hjælper videnskabsmænd med at identificere funktionelle aspekter af forskellige gener i levende organismer.
Hvad er Gene Knockout?
Gen-knockout er en genetisk teknik, der gør et eller flere gener uvirksomme i levende organismer. Dette er også en proces med at slukke eller slette et gen fra en organisme. Den primære anvendelse af denne teknik er at studere genfunktionen. Processen evaluerer effekten af det tabte eller fjernede gen. Knockout-processen involverer også visse enzymer og splejsningsteknikker.
Figur 01: Gene Knockout
Der er få variationer i gen-knockout-teknikken baseret på antallet af involverede gener. De er dobbelt knockout (knockout af to gener), triple knockout (knockout af tre gener) og firdobbelt knockout (knockout af fire gener). Gen-knockout er yderligere klassificeret i to grupper; heterozygote knockouts og homozygote knockouts.
Hvad er Gene Knockdown?
Gen knockdown er en eksperimentel procedure, hvor denne procedure undertrykker eller reducerer ekspressionen af et bestemt gen eller gener i en organisme. Gendæmpning er den almindelige definition på gen-knockdown. Under denne procedure involverer aktiveringen eller nedbrydningen af det producerede mRNA RNA-interferens (RNAi), lille interfererende RNA (siRNA) og kort hårnåle-RNA (shRNA).
Figur 02: Gendæmpning
Den primære anvendelse af gen-knockdown er at undersøge det særlige gens rolle i det biologiske system. Derfor udfører denne teknik studiet af onkogener (Bcl-2 og P53) og gener, der forårsager neurologiske sygdomme, virusinfektioner og arvelige sygdomme.
Hvad er lighederne mellem Gene Knockout og Knockdown?
- Både gen-knockout og gen-knockdown er genetiske teknikker.
- Disse to teknikker kan forhindre genekspression.
- Den primære anvendelse af begge teknikker er at undersøge funktionen af genet af interesse.
- Begge er i stand til at identificere forskellige sygdomstilstande (genetiske).
- De kunne begge bruges til et eller flere gener af interesse.
Hvad er forskellen mellem Gene Knockout og Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gen knockout er in-operation af gener (fjernelse af gener fra DNA) fra en organisme gennem forskellige genetiske teknikker. | Gen knockdown er en eksperimentel procedure til at undertrykke (reducere eller dæmpe) ekspressionen af et bestemt gen eller gener i en organisme. |
| Function | |
| Faciliterer studiet af geners funktioner ved at analysere resultaterne af det tabte gen. | Faciliterer studiet af onkogener, gener, der forårsager neurologiske sygdomme, virusinfektioner og arvelige sygdomme. |
| Involvering af RNA-agenter | |
| Involvering af RNA-midler er ubetydelig i denne teknik. | Processen involverer midler såsom siRNA, shRNA og RNAi for at inaktivere mRNA'et. |
| Brug af kemiske midler | |
| Enzymatiske midler bruges. | Der bruges ingen sådanne kemiske midler. |
| Effekt på gen | |
| Fjerner genet fuldstændigt fra DNA'et. | Undertrykke eller dæmpe genet. |
| Klassificering | |
| Dobbelt knockout, tredobbelt knockout og firedobbelt knockout og heterozygot og homozygot knockout er forskellige typer gen-knockout. | Ingen sådanne klassifikationssystemer tilgængelige til gendæmpning. |
Opsummering – Gene Knockout vs Gene Knockdown
De to teknikker, vi diskuterede her; genet knockout og knockdown, er metoder til at undersøge forskellige geners funktioner. Gen-knockout gør genet uvirksomt, mens gen-knockdown dæmper genet af interesse. Imidlertid forhindrer begge procedurer genekspressionen. Forskellige midler er i stand til at udføre disse to processer. Gen-knock-out er en type sletning, mens gen-knockdown er en form for inaktivering. Dette er forskellen mellem gen-knock-out og knockdown.
