Nøgleforskellen mellem Cosmid og Phagemid er den type sekvenser, den indeholder. Et Cosmid indeholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor, mens et Phagemid er et plasmid, der indeholder et F1-replikationsstartsted for F1-fagen.
Cosmider og Phagemider bruges til kloningsformål, især til at klone større fragmenter af DNA. Disse er meget udbredt, især i kloning af gener, der er ansvarlige for produktionen af forskellige proteiner. Kosmider og fagmider replikeres enten alene som plasmider eller pakkes i virale partikler og replikeres derefter.
Hvad er en Cosmid?
Et Cosmid, der refereres til som et hybridplasmid, omfatter cos-steder ekstraheret fra Lambda-fagpartikler og et plasmid. Disse cos-steder er lange fragmenter af DNA med 200 basepar. Derfor har de sammenhængende eller klæbrige ender, der tillader plasmidet at passe ind i det virale DNA. Derfor er cos-stederne afgørende for pakning af DNA'et.
Der er tre cos-steder;
- cosN-sted – involveret i at skære DNA-strengen ved terminaseaktivitet
- cosB-websted – engageret i at holde terminase.
- cosQ-sted – involveret i at forhindre nedbrydning af DNA'et af DNaser.
Figur 01: Cosmid
Cosmider kan også enten replikere enkeltstrenget DNA eller dobbeltstrenget DNA under anvendelse af et passende replikationsorigin. Cosmider indeholder sædvanligvis antibiotikaresistensgener som markører for selektion af transformanter. Således kan brugen af et cosmid som en vektor lette kloningen, og restriktionsenzymfordøjelsen af vektoren kan derefter ekstrahere disse fragmenter.
Hvad er en Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, også kaldet Phasmid, er også en type hybridvektor. Phagemid indeholder et særligt replikationsstartsted, der kaldes f1 replikationsstartstedet. f1-replikationsoriginet ekstraherer fra en f1-fag.
Phagemid kan replikere både enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA. Replikation kan enten finde sted som et plasmid, mens det gennemgår uafhængig replikation eller kan blive pakket ind i fagpartikler og til sidst inficere bakteriel vært E coli. Ved infektion af E coli-cellerne kræver f1-fagen tilstedeværelsen af en pilus. Derfor er sexpili vigtige under in vitro-pakning af Phagemider.
Hvad er lighederne mellem Cosmid og Phagemid?
- Både Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer, der bruges i rekombinant DNA-teknologi.
- Cosmid og Phagemid kan replikere enkeltstrenget og dobbeltstrenget DNA.
- Begge kan gennemgå uafhængig replikation svarende til plasmider.
- Cosmid og Phagemid kan gennemgå in vitro-pakning og inficere bakterieceller.
- Både Cosmid og Phagemid kræver et passende replikationsorigin til kloning.
Hvad er forskellen mellem Cosmid og Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid er en hybridvektor, der indeholder et cos-sted og et plasmid. | Phagemid er et plasmid, der indeholder et F1-replikationsstartsted for F1-fagen. |
| Tilstedeværelse af Cos-websteder | |
| Cos-websteder er til stede i cosmid og er nødvendige for in vitro-pakning. | Cos-websteder er fraværende i phagemid. |
| Tilstedeværelse af F1-oprindelse for replikering | |
| I cosmid kan fi-replikationsstartstedet være til stede eller ikke. | F1 replikationsstartsted er til stede i fagmid. |
| Tilstedeværelse af antibiotikaresistente gener | |
| Antibiotika-resistente gener er til stede i kosmider for at identificere transformanterne fra ikke-transformanter. | Antibiotika-resistente gener er fraværende i fagmider. |
| Krav til in vitro-emballage | |
| Kræver et cos-websted. | Kræver en sexpilus. |
Opsummering – Cosmid vs Phagemid
Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer, der bruges i rekombinant DNA-teknologi. Cosmider er hybridvektorer, der indeholder specielle klæbrige ender kendt som cos-steder. in vitro-emballage kræver disse cos-steder. Mens fagmider er plasmider, der indeholder et fl-replikationsstartsted ekstraheret fra f1-fag. Både cosmid og fagemid kan gennemgå uafhængig replikation eller in vitro-pakning til bakterieceller. Dette er de vigtige forskelle mellem kosmid og fagmid.
