Nøgleforskellen mellem EcoRI og HindIII restriktionsenzymer er, at EcoRI er et type II restriktionsenzym, der er isoleret fra E. coli, mens HindIII er et type II restriktionsenzym, der er isoleret fra Haemophilus influenza.
Restriktionsenzym eller restriktionsendonuklease er et enzym, der sp alter DNA til fragmenter på specifikke genkendelsessteder (restriktionssteder) i DNA-molekylet. Disse restriktionsenzymer findes i bakterier og arkæer. De giver en forsvarsmekanisme mod invaderende vira. Restriktionsenzymer er generelt klassificeret i fem forskellige typer: type I, type II, type III, IV og type V. EcoRI og HindIII er to restriktionsenzymer, der tilhører gruppen af type II restriktionsenzymer.
Hvad er EcoRI-restriktionsenzymer?
EcoRI er et type II restriktionsenzym, der er isoleret fra E.coli-arter. Det er et restriktionsenzym, der sp alter DNA-dobbeltspiraler til fragmenter på specifikke steder. EcoRI er også en del af restriktionsmodifikationssystemet. EcoRI var det første enzym, der oprindeligt blev isoleret fra RY13-stammen af E. coli-arten. Det bruges som et restriktionsenzym i molekylærbiologi. EcoRI skaber 4 nukleotid-klæbende ender med 5'-endeudhæng af AATT. EcoRI skærer DNA'et ved den specifikke genkendelsessekvens G↓AATTC. Det har den palindromiske komplementære sekvens af CTTAA↓G. Desuden hører dette restriktionsenzym til underklassen type II P (palindromisk specificitet). I sin primære struktur indeholder EcoRI PD. D/EXK-motivet i sit aktive sted, ligesom mange andre restriktionsenzymer.
Figur 01: EcoRI
EcoRI restriktionsenzym er en homodimer på 31 kDa. Den indeholder et kugleformet domæne af α/β-arkitekturen. Hver underenhed indeholder en løkke, der stikker ud fra det kugleformede domæne og omslutter DNA'et, når det bindes. Dette enzym kan cokrystalliseres med den sekvens, det norm alt skærer. Desuden bruges EcoRI-restriktionsenzymet i en lang række molekylærgenetiske teknikker, herunder kloning, DNA-screening og deletionssektioner af DNA in vitro-betingelser.
Hvad er HindIII-restriktionsenzymer?
HindIII er et type II restriktionsenzym, der er isoleret fra Haemophilus influenza-arter. Den sp alter DNA-palindromsekvensen AACCTT i nærvær af cofaktoren Mg2+ gennem hydrolyse. Sp altningen af denne særlige sekvens mellem AA'S (5'A↓ACCTT3' og 3'TTCGA↓A5') resulterer i 5' udhæng på DNA-molekylet kaldet klæbrige ender. Dette enzym findes i prokaryote organismer som bakterier. Bakterier bruger dette enzym som en forsvarsmekanisme mod vira såsom bakteriofager.
Figur 02: HindIII
Strukturelt er HindIII en homodimer. Den indeholder en fælles strukturel kerne, der omfatter fire β-ark og en enkelt α-spiral, ligesom andre typer II-restriktionsenzymer. Molekylmassen af dette enzym er 34,9 kDa. Desuden er HindIII meget nyttig i moderne molekylærbiologiske eksperimenter såsom DNA-sekventering og kortlægning.
Hvad er lighederne mellem EcoRI- og HindIII-restriktionsenzymer?
- EcoRI og HindIII er to restriktionsenzymer, der tilhører type II-restriktionsenzymgruppen.
- EcoRI og HindIII blev fundet i begyndelsen af 1970'erne.
- EcoRI og HindIII indeholder begge PD.. D/EXK-aminosyresekvensmotivet.
- Begge restriktionsenzymer udfører meget specifik sp altning af DNA'et.
- Disse restriktionsenzymer har brug for Mg2+ som en cofaktor for deres specifikke aktivitet.
- De producerer klæbrige ender efter at have skåret DNA.
- De er meget nyttige komponenter i moderne molekylærbiologisk forskning.
Hvad er forskellen mellem EcoRI- og HindIII-restriktionsenzymer?
EcoRI er et type II-restriktionsenzym, der er isoleret fra E.coli-arter, mens HindIII er et type II-restriktionsenzym, der er isoleret fra Haemophilus influenza-arter. Dette er således den vigtigste forskel mellem EcoRI og HindIII. Desuden skærer EcoRI DNA'et ved den specifikke genkendelsessekvens G↓AATTC, mens HindIII skærer DNA'et ved den specifikke genkendelsessekvens A↓ACCTT.
Nedenstående infografik præsenterer forskellene mellem EcoRI og HindIII i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – EcoRI vs HindIII restriktionsenzymer
EcoRI og HindIII er to restriktionsenzymer, der tilhører type II p-underklassen. De udfører meget specifik sp altning af DNA'et. EcoRI er et type II-restriktionsenzym, der er isoleret fra E.coli-arter, mens HindIII er et type II-restriktionsenzym, der er isoleret fra Haemophilus influenza-arter. Så dette opsummerer forskellen mellem EcoRI og HindIII.
