Nøgleforskellen mellem DNA og proteinmikroarray er, at DNA-mikroarray er en samling af mikroskopiske DNA-pletter knyttet til en fast overflade som et objektglas, mens proteinmikroarray er et arrangement af rensede proteiner på en fast overflade som et glas dias.
Microarray er et laboratorium på en chip-enhed (LOC). Det er en miniature, multiplex, parallel bearbejdnings- og detektionsenhed. Det er også et todimensionelt array på en solid overflade, såsom et objektglas eller en tyndfilmscelle af silicium. Et mikroarray analyserer en stor mængde biologisk materiale ved hjælp af high-throughput screening. Det første mikroarray var antistofchippen, der blev introduceret af Tse Wen Chang i 1983. Den første genchip blev introduceret i 1995 af Ron Davis og Pat Brown ved Stanford University. Derfor er DNA- og proteinmikroarray to typer mikroarray-enheder.
Hvad er DNA Microarray?
DNA-mikroarray er en samling af mikroskopiske DNA-pletter, der er fastgjort til en fast overflade som et objektglas. Forskere bruger DNA-mikroarray til at måle ekspressionen af et stort antal gener samtidigt. Det bruges også til at genotype flere regioner af et genom. DNA-mikroarrayet er forberedt ved hjælp af robotmaskiner. Disse maskiner arrangerer hundredvis eller tusindvis af gensekvenser (prober) på et enkelt mikroskopisk objektglas.
Figur 01: DNA-mikroarray
I et DNA-mikroarray indeholder hver DNA-plet picomoler (10−12 mol) af en specifik DNA-sekvens. Disse DNA-sekvenser er også kendt som prober eller reportere. Disse prober er et kort DNA-segment af et gen eller et andet DNA-element. De kan hybridisere med cDNA eller CRNA i en prøve under betingelser med høj stringens. De fluorescensmærkede prøvesekvenser, der binder til prober, genererer signaler, der afhænger af hybridiseringsbetingelser såsom temperatur. Derfor kan denne metode bruges til at bestemme den relative mængde af nukleinsyresekvenser i prøven. Desuden er DNA-mikroarray-teknikken i vid udstrækning anvendt i genekspressionsundersøgelser, komparative genomiske undersøgelser, kontrol af kontaminering af fødevarer eller cellekulturer med patogener, evaluering af genmutationer, identifikation af lægemiddelkandidater, genetisk koblingsanalyse osv.
Hvad er Protein Microarray?
Protein-mikroarray er et arrangement af rensede proteiner på en fast overflade som et objektglas. Det er en metode, der bruges til at detektere interaktioner og aktiviteter af proteiner. Det bruges også til at bestemme funktionerne af proteiner i stor skala. Den største fordel ved proteinmikroarray er, at et stort antal proteiner kan spores parallelt. Protein-mikroarray er en chip, der består af en støtteoverflade som glasglas, nitrocellulosemembran, perle eller mikrotiterplade. Indfangningsproteinerne (antistoffer, antigener) er bundet til denne faste overflade. Probemolekylerne, der norm alt er mærket med et fluorescerende farvestof, tilføjes senere til arrayet. Hybridiseringen mellem probe og immobiliserede proteiner udsender et fluorescerende signal, der kan detekteres af en laserscanner.
Figur 02: Protein Microarray
Det første proteinarray er et antistofmikroarray (antistofmatrix), som blev introduceret i 1983. Proteinmikroarrays er hurtige, automatiserede, meget følsomme og økonomiske. De forbruger også kun en lille mængde prøver og reagenser. Desuden anvendes proteinmikroarrays i vid udstrækning til sygdomsdiagnostik, proteinfunktionel analyse, antistofkarakterisering og behandlingsudvikling.
Hvad er lighederne mellem DNA og proteinmikroarray?
- DNA og proteinmikroarray er to typer mikroarrayenheder.
- Begge enheder er baseret på hybridiseringsprincippet.
- Begge enheder bruger sonder.
- De bruger også fluorescenssignaler til at detektere hybridisering.
- De er begge umådeligt hjælpsomme til sygdomsdiagnostik i medicin.
Hvad er forskellen mellem DNA og proteinmikroarray?
DNA-mikroarray er en samling af mikroskopiske DNA-pletter, der er fastgjort til en fast overflade som et objektglas. I modsætning hertil er proteinmikroarray et arrangement af oprensede proteiner på en fast overflade som et objektglas. Så dette er den vigtigste forskel mellem DNA og proteinmikroarray. Desuden er prøven og proben i et DNA-mikroarray DNA-sekvenser. På den anden side i proteinmikroarray er prøven og proben proteiner.
Den følgende infografik præsenterer forskellene mellem DNA og proteinmikroarray i tabelform.
Opsummering – DNA vs Protein Microarray
Et mikroarray er et high-throughput og multiplex lab-on-a-chip. Den er lavet ud fra hybridiseringsprincippet. DNA og protein mikroarray er to typer mikroarray-enheder. DNA-mikroarray er en samling af mikroskopiske DNA-pletter knyttet til en fast overflade som et objektglas. På den anden side er proteinmikroarray et arrangement af oprensede proteiner på en fast overflade som et objektglas. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem DNA og proteinmikroarray.
