Nøgleforskel – generelle vs specifikke transskriptionsfaktorer
Transskriptionsfaktorer kræves af RNA-polymerase for at virke på DNA-templatestrengen ved syntetisering af mRNA. Der er forskellige typer af transskriptionsfaktorer. Disse transkriptionsfaktorer danner et kompleks med DNA-strengen. De ændrer enten bekræftelsen af skabelonstrengen eller øger affiniteten af RNA-polymeraseenzymet til mRNA-syntese i processen med kaldet transkription. Der er to hovedtyper af transkriptionsfaktorer. De er generelle eller basale transkriptionsfaktorer og de specifikke transkriptionsfaktorer. De generelle transkriptionsfaktorer er de faktorer, der bruges til at danne præ-initieringskomplekset under transkriptionsprocessen. De er til stede i næsten alle eukaryoter, og i prokaryoter danner de et mindre kompliceret kompleks. De specifikke transkriptionsfaktorer er enten forstærkere eller repressorer, som er specifikke DNA-sekvenser, der aktiverer eller undertrykker den generelle transkriptionsproces. Nogle specifikke transkriptionsfaktorer kan ændre selve DNA-sekvensen. Nøgleforskellen mellem de generelle transkriptionsfaktorer og de specifikke transkriptionsfaktorer er baseret på funktionaliteten. Generelle transkriptionsfaktorer er involveret i dannelsen af et præ-initieringskompleks af transkriptionsprocessen, hvorimod specifikke transkriptionsfaktorer deltager i enten at aktivere eller undertrykke transkriptionsprocessen.
Hvad er generelle transskriptionsfaktorer?
Generelle eller basale transkriptionsfaktorer er de faktorer, der er involveret i dannelsen af initieringskomplekset under transkription. De er essentielle for transkriptionsprocessen, derfor spiller de en afgørende rolle i den vellykkede transskription. Der er seks vigtige generelle transkriptionsfaktorer. De er; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF og TFIIA. De spiller forskellige roller under dannelsen af indvielseskomplekset.
- TFIID – Denne transkriptionsfaktor (TF) er involveret i at genkende promotorsekvensen (TATA-boks).
- TFIIB – Promotor/TFIID-komplekset genkendes af TFIIB. Dette giver et signal til bindingen af det vigtigste katalyserende enzym RNA-polymerase.
- TFIIF – Denne transkriptionsfaktor er bundet til RNA-polymerasen. TFIIF deltager således i processen ved at rekruttere RNA-polymerasen til den korrekte placering.
- TFIIE og TFIIH – Bindingen af disse transkriptionsfaktorer markerer afslutningen på dannelsen af præ-initieringen Binding af disse øger effektiviteten af dannelsen af præ-initieringskomplekset.
- TFIIA fremmer bindingen af TFIID til TATA-boksen.
Figur 01: Generelle transskriptionsfaktorer
Ovennævnte generelle transkriptionsfaktorer er specifikke for RNA-polymerase II, som er den type RNA-polymerase, der forlænger mRNA-strengen. Der er generelle transkriptionsfaktorer involveret i RNA-polymerase I og III. Generelle transkriptionsfaktorer kan også afvige afhængigt af den celletype, den virker på.
Hvad er specifikke transskriptionsfaktorer?
Specifikke transkriptionsfaktorer er regioner, der også er placeret i DNA-sekvenserne. De er for det meste enten forstærkere eller undertrykkere. Specifikke transkriptionsfaktorer er de specifikke cis-virkende elementer i template-DNA-strengen, der gennemgår transkription. Aktivering af disse specifikke forstærkere og repressorer deltager i at øge enzymets affinitet ved at ændre orienteringen af DNA-molekylet eller ved at fungere som signalområder. Specifikke transkriptionsfaktorer bruges også til at inducere modifikationer af DNA-templatestrengen. Disse modifikationer involverer hovedsageligt kovalente modifikationer såsom methylering. Derved fungerer methylerede DNA-regioner som særlige forstærkere eller repressorer af transkriptionsprocessen.
Figur 02: Specifikke transskriptionsfaktorer
De specifikke transkriptionsfaktorer afhænger af arten og findes ikke almindeligt i alle eukaryoter. Disse transkriptionsfaktorer aktiveres af forskellige metaboliske forhold via sign altransduktionsveje. Ved aktivering regulerer de ekspressionen af genet på et transskriptionelt niveau.
Hvad er lighederne mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer?
- Begge faktorer er nødvendige i processen med transskription.
- Begge faktorer påvirker genekspressionen af en organisme.
- Begge faktorer hjælper med at regulere funktionen af RNA-polymerase i transkriptionsprocessen.
- Begge faktorer findes for det meste i eukaryoter.
Hvad er forskellen mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer?
Generel versus specifik transskription |
|
| De generelle transkriptionsfaktorer er de faktorer, der bruges til at danne præ-initieringskomplekset under transkriptionsprocessen. | De specifikke transkriptionsfaktorer er enten forstærkere eller repressorer, som er specifikke DNA-sekvenser, der aktiverer eller undertrykker den generelle transkriptionsproces. |
| Type af molekyle | |
| Generelle transkriptionsfaktorer er proteinbaserede. | Specifikke transkriptionsfaktorer er nukleotidsekvenser. |
| Formation | |
| Generelle transkriptionsfaktorer danner præ-initieringskomplekset under transkriptionsinitieringen. | Specifikke transkriptionsfaktorer virker som forstærkere eller undertrykkere af transskription. |
| Typer | |
| Der er seks hovedtyper; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE og TFIIA af generelle transkriptionsfaktorer. | Specifikke transkriptionsfaktorer kategoriseres hovedsageligt som forstærkere og undertrykkere. |
Opsummering – generelle vs specifikke transskriptionsfaktorer
Transkriptionsfaktorer er essentielle for den transskriptionelle regulering og er nødvendige for den øgede effektivitet og nøjagtighed af processen. Transskriptionsfaktorer er to hovedtyper; Generelt/Basal og Specifik. Generelle transkriptionsfaktorer er involveret i dannelsen af præ-initieringskomplekset under transkription, hvorimod specifikke transkriptionsfaktorer er regioner i selve DNA'et, der fungerer som forstærkere eller repressorer. Generelle transkriptionsfaktorer er proteinbaserede og kræves af alle eukaryoter. Det varierer ikke meget og forbliver som ensartede molekyler. En specifik transkriptionsfaktor kan variere meget og afhænger af individets genetiske sammensætning. Dette er forskellen mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer.
Download PDF-versionen af generelle vs specifikke transskriptionsfaktorer
Du kan downloade PDF-versionen af denne artikel og bruge den til offline-formål i henhold til citatnotat. Download venligst PDF-versionen her Forskel mellem generelle og specifikke transskriptionsfaktorer
