siRNA vs miRNA
RNA'er er meget vigtige molekyler, som hjælper med at opbygge organismers liv. For nylig har forskere opdaget små RNA'er kaldet RNA-interferens eller RNAi, som efter transskriptionen virker til at kontrollere genekspression. De to hovedtyper af små RNA'er er mikro-RNA eller miRNA og små interfererende RNA eller siRNA. Disse molekyler regulerer grundlæggende genekspressionen ved at undertrykke målgenet. Både miRNA og siRNA har meget ens biogenese-veje, selvom der er nogle forskelle mellem dem. Oprindelsen af miRNA og siRNA er fra dsRNA-molekyler. Modne miRNA'er ligner strukturelt siRNA-molekyler.
miRNA
Mikro-RNA'er eller miRNA'er er de små RNA-molekyler, som formidler den endelige kontrol i translationel genregulering. Deregulering af miRNA kan føre til kræft og anden sygdomsudvikling. Derfor er den korrekte regulering af information kodet i den ikke-kodende region af miRNA meget kritisk i mange fundamentale cellulære processer.
siRNA
siRNA'er omtales også som kort interfererende eller dæmpende RNA og består af dobbeltstrenget RNA med 20 til 25 basepar. Hovedrollen for siRNA er at interferere med ekspressionen af specifikke gener med komplementære nukleotidsekvenser. siRNA består af kort dobbeltstrenget RNA med phosphorylerede 5'-ender og hydroxylerede 3'-ender med to overhængende nukleotider.
Hvad er forskellen mellem siRNA og miRNA?
• miRNA afledt af specifikke genomiske loci, mens siRNA afledt af mRNA, transposoner, vira eller heterokromatisk DNA.
• Syntese af miRNA behandles fra længere precursor hårnåle-transkripter (primær nuklear miRNA-sekvens af RNase III-endonuklease), hvorimod den af siRNA behandlet fra lange bimolekylære RNA-duplekser.
• Hvert miRNA-hårnåle-precursor-molekyle producerer enkelt miRNA-dupleks, hvorimod hvert siRNA-precursor-molekyle producerer flere siRNA-duplekser.
• siRNA-sekvenser er sjældent konserverede, mens miRNA-sekvenser er godt konserverede.
• Alle baser i siRNA bidrager til dets målspecificitet, hvorimod kun 5' halvdelen af miRNA bidrager til dets målspecificitet.
• miRNA binder ofte til den 3' utranslaterede region af måltranskripter, hvorimod siRNA'er danner komplementær dupleks hvor som helst langs et mål-mRNA.
• miRNA specificerer 'hetero- silencing', mens siRNA bruges til 'auto silencing'.
• miRNA fungerer som et signal til at forhindre oversættelse, hvorimod siRNA fysisk forhindrer oversættelse.
