Nøgleforskellen mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid er, at guanidinthiocyanat er et stærkere proteindenatureringsmiddel, der er mere almindeligt anvendt i RNA-isolering, mens guanidinhydrochlorid er et svagere proteindenatureringsmiddel, der er mindre almindeligt anvendt i RNA-isolering.
Denaturering er den proces, hvor proteiner mister deres kvaternære struktur, tertiære struktur og sekundære struktur, der norm alt er til stede i deres native tilstand. Det kan gøres ved påføring af ekstern stress eller forbindelser såsom en stærk syre eller base, et koncentreret uorganisk s alt, et organisk opløsningsmiddel (alkohol, chloroform), agitation, stråling eller varme. Guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid er to forskellige typer proteindenatureringsmidler.
Hvad er guanidinthiocyanat?
Guanidinthiocyanat (GTC) er et stærkere proteindenatureringsmiddel, der er mere almindeligt anvendt i RNA-isolering. Det er også kendt som guanidinium isothiocyanat (GITC). Da det er et kaotropt middel, er det en kemisk forbindelse, der rutinemæssigt anvendes som en generel proteindenatureringsmiddel. Et kaotropt middel er et molekyle i en vandopløsning, der kan forstyrre hydrogenbindingsnetværket mellem vandmolekyler. Dette har en effekt på stabiliteten af den native tilstand af andre molekyler i opløsningen, såsom makromolekyler som proteiner og nukleinsyrer, ved at svække den hydrofobe virkning. Kaotrope midler som guanidinthiocyanat reducerer mængden af orden i strukturen af protein dannet af vandmolekyler både i bulk og hydreringsskaller omkring hydrofobe aminosyrer. Dette kan forårsage proteindenaturering.
Guanidinthiocyanat kan bruges til at deaktivere vira såsom influenza, der forårsagede sygdomme som den spanske syge i 1918. Derfor kan den bruges i medicinske eller hospitalsopsætninger. Ydermere bruges guanidinthiocyanat også til at lysere celler og viruspartikler i RNA- og DNA-ekstraktioner. Her er funktionen af guanidinthiocyanat at hjælpe med lyserende virkning og at forhindre aktiviteten af RNase-enzymer og DNase-enzymer ved denaturering. Disse enzymer ville ellers beskadige ekstraktet (RNA eller DNA).
Hvad er guanidinhydrochlorid?
Guanidinhydrochlorid (GdnHCl) er et svagere proteindenatureringsmiddel, der er mindre almindeligt anvendt i RNA-isolering. Det er også kendt som guanidiniumchlorid (GdmCl). Det er hydrochlorids altet af guanidin. Guanidinhydrochlorid er kaotropisk og et af de denatureringsmidler, der anvendes i de fysisk-kemiske undersøgelser af proteinfoldning.
Figur 01: Guanidinhydrochlorid
Guanidinhydrochlorid har også evnen til at reducere enzymaktivitet og øge opløseligheden af hydrofobe molekyler. Norm alt, ved højere koncentrationer af guanidinhydrochlorid, mister proteiner deres ordnede struktur. Proteiner har en tendens til at blive tilfældigt viklede ved denne koncentration af guanidinhydrochlorid. I medicinske eller hospitalsopstillinger er guanidinhydrochlorid indiceret til reduktion af symptomerne på muskelsvaghed og let træthed forbundet med sygdommen Eaton-Lamberts syndrom. Ydermere kan bivirkninger ved brug af guanidinhydrochlorid omfatte perist altik, diarré og dødelig knoglemarvssuppression.
Hvad er lighederne mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid?
- Guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid er to forskellige typer proteindenatureringsmidler.
- Begge denaturanter har guanidin i deres strukturer.
- De er kaotrope agenter.
- Begge denaturanter kan bruges til RNA-isolering.
- De bruges begge i medicinske eller hospitalsopsætninger.
Hvad er forskellen mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid?
Guanidinthiocyanat er et stærkere proteindenatureringsmiddel, der er mere almindeligt anvendt i RNA-isolering, mens guanidinhydrochlorid er et svagere proteindenatureringsmiddel, der er mindre almindeligt anvendt i RNA-isolering. Dette er således den vigtigste forskel mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid. Ydermere er den kemiske formel for guanidinthiocyanat C2H6N4S, mens den kemiske formel af guanidinhydrochlorid er CH5N3HCl.
Nedenstående infografik viser forskellene mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Guanidinthiocyanat vs Guanidinhydrochlorid
Guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid er to forskellige typer proteindenatureringsmidler. Begge denatureringsmidler er kaotrope. Guanidinthiocyanat er et stærkere proteindenatureringsmiddel, der er mere almindeligt anvendt i RNA-isolering, mens guanidinhydrochlorid er et svagere proteindenatureringsmiddel, der er mindre almindeligt anvendt i RNA-isolering. Så dette opsummerer forskellen mellem guanidinthiocyanat og guanidinhydrochlorid.
