Nøgleforskellen mellem TATA- og CAAT-boksen er, at TATA-boksen er en konserveret nukleotidregion, som har en konsensussekvens af TATAWAW, mens CAAT-boksen er en konserveret nukleotidregion med en konsensussekvens af GGCCAATCT.
TATA-boks og CAAT-boks er to regioner af nukleotider, der påvirker transskription af eukaryote gener. De er ikke-kodende DNA-sekvenser fundet opstrøms til transkriptionsinitieringsstedet. Faktisk findes de i den regulatoriske region, som er kendt som promotoren. Både TATA-boks og CAAT-boks er ansvarlige for effektiviteten af transskription. De er konsensussekvenser, som ikke har ændret sig gennem hele evolutionsprocessen.
Hvad er TATA Box?
TATA-boks eller Goldberg-Hogness-boks er en konsensussekvens, der findes i promotorregionen af eukaryote gener. TATA-boksen er et kerneelement i promotoren. Det er placeret 25 basepar opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet. Det er bevaret gennem hele evolutionsprocessen. Konsensussekvensen for TATA-boksen er TATAWAW, hvor W er enten A eller T. Det er en ikke-kodende DNA-sekvens. TATA-boks er dog vigtig for transskriptionen af genet. Det er bindingsstedet for TATA-bindende protein (TBP) og andre transkriptionsfaktorer. Når de først binder sig ind i TATA-boksen, finder rekrutteringen af RNA-polymerase II og korrekt regulering af transkription sted i eukaryote gener.
Figur 01: TATA Box
Da TATA-boksen er involveret i reguleringen af transskription, kan mutationer af TATA-boksen resultere i fænotypiske ændringer, der fører til sygdomme som mavekræft, spinocerebellar ataksi, Huntingtons sygdom, blindhed, β-thalassæmi, immunsuppression, Gilberts syndrom, og HIV-1 osv.
Hvad er CAAT Box?
CAAT-boksen er en region af nukleotider med konsensussekvensen af GGCCAATCT. I lighed med TATA-boksen er CAAT-boksen også placeret i promotorregionen af genet. Derfor er den placeret omkring 75-80 basepar opstrøms for transskriptionsstedet.
Figur 02: CAAT Box
Specifikke transskriptionsfaktorer binder til CAAT-boksen. Denne binding stabiliserer præinitieringskomplekset for lettere binding af enzymet RNA-polymerase. Ligeledes fungerer CAAT-boksen som en regulatorisk sekvens. Mutationer i CAAT-boksregionen påvirker i høj grad promotorresponsen og reguleringen af transkription.
Hvad er lighederne mellem TATA og CAAT Box?
- TATA og CAAT er to regioner af nukleotider, der findes i den regulatoriske sekvens af eukaryote gener.
- De findes opstrøms til transkriptionsinitieringsstedet.
- Begge er konsensus-DNA-sekvenser.
- De er afgørende for reguleringen af transskription, så de er regulatoriske sekvenser.
Hvad er forskellen mellem TATA og CAAT Box?
TATA-boks er en konserveret nukleotidregion fundet omkring 25-30 basepar opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet. På den anden side er CAAT-boks en konserveret region af nukleotider fundet omkring 75-80 basepar opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet. Så dette er den vigtigste forskel mellem TATA og CAAT box. Desuden har TATA-boksen en konsensussekvens af TATAWAW, mens GGCCAATCT er konsensussekvensen for CAAT-boksen.
En anden væsentlig forskel mellem TATA- og CAAT-boksen er desuden, at TATA-boksen giver et bindingssted for TBP og transkriptionsfaktorer og deltager i transkriptionsregulering, mens CAAT-boksen signalerer bindingsstedet for RNA-transkriptionsfaktoren.
Infografikken nedenfor opsummerer forskellene mellem TATA- og CAAT-boksen.
Oversigt – TATA vs CAAT Box
TATA-boksen og CAAT-boksen er to dele af den konserverede region af eukaryote genpromotorer. De er placeret opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet. Begge påvirker transskriptionen af gener ved at tilvejebringe steder for binding af TATA-bindende proteiner og transkriptionsinitieringsfaktorer. TATA-boksen er placeret 25-35 basepar opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet, mens CAAT-boksen er placeret 75-80 basepar opstrøms for transkriptionsinitieringsstedet. Konsensussekvensen for TATA-boksen er TATAWAW, mens konsensussekvensen for CAAT-boksen er GGCCAATCT. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem TATA og CAAT box.
