Nøgleforskellen mellem motiv og domæne er, at motivet ikke er uafhængigt stabilt, mens domænet er uafhængigt stabilt.
Proteiner er vigtige biologiske makromolekyler, der findes i vores krop. På den anden side vil den genetiske kode af et gen bestemme aminosyresekvensen af et protein. Desuden har proteiner primære, sekundære og tertiære strukturer. Den primære struktur er aminosyresekvensen af polypeptidkæden. Når polypeptidkæder foldes med hinanden, danner det proteinets sekundære struktur. Alfa-spiraler, beta-ark og supersekundære strukturer hører til de sekundære strukturer. Visse grupperinger af supersekundære elementer er kendt som proteinmotiver. Den tertiære struktur af et protein refererer til dets tredimensionelle struktur, der bestemmer proteinets funktion. Domæne er en foldet del af et proteinmolekyle, som er kugleformet og har en diskret funktion. Det er den grundlæggende funktionelle og tredimensionelle struktur af proteinet.
Hvad er motiv?
Motif er en bestemt gruppering af de supersekundære elementer i proteiner såsom alfa-helixer og beta-strukturer. De er en slags mønstre til stede i forskellige proteiner. Motiver beskriver foldemønstrene for de sekundære strukturelle elementer og deres interaktioner. Disse foldemønstre stabiliseres af lignende bindinger, som er til stede i tertiære strukturer. De er dog ikke så komplekse som tertiære strukturer.
Figur 01: Motiv
De er simple kombinationer af sekundære strukturer af proteiner. Motivet er ikke stabilt i sig selv. Desuden forklarer motiver strukturen af et protein, men forudsiger ikke funktionen af et protein. Eksempler på proteinmotiver er et beta-alfa-beta-motiv, græsk nøglemotiv, Beta-tønde, Beta-meander-motiv osv.
Hvad er domæne?
Domæne er en grundlæggende, funktionel og tredimensionel enhed af et protein. Den udfører en bestemt funktion. Et enkelt protein kan have flere forskellige domæner. Hvert domæne er en selvstændig enhed. Det er en kugleformet struktur. Den er ansvarlig for en bestemt funktion eller interaktion. Domæner kan bruges til at opstille en hypotese om funktionen af et ukarakteriseret protein. Når man analyserer et protein, er det vigtigt at tage det i betragtning, da domæner er proteinets funktionelle enheder.
Figur 02: Tre forskellige domæner af Pyruvate Kinase
Domæner er meget stabile og kompakte strukturer. De kan let skelnes fra andre regioner. Pyruvatkinase har tre forskellige domæner som vist i figur 02. Længden af domænet kan variere, og den gennemsnitlige længde er 100 aminosyrer. Hvert domæne indeholder en hydrofob kerne bygget af sekundære strukturelle enheder. Flere domæner danner tilsammen den tertiære struktur af et protein.
Hvad er lighederne mellem motiv og domæne?
- Motiv og domæne er enheder til stede i selve proteinmolekylerne.
- De er nyttige ved klassificering af proteinfamilier.
Hvad er forskellen mellem motiv og domæne?
Motiv er en bestemt gruppering af de supersekundære elementer i proteiner såsom alfa-helixer og beta-strukturer, mens domæne er den funktionelle enhed af et protein. Desuden er motiv en sekundær struktur, mens domæne er ansvarlig for proteinets tertiære struktur. Desuden er domæne en selvstændig enhed i modsætning til et motiv. Også domæne skildrer funktionen af et protein, mens motiv ikke er det. Dette er de vigtigste forskelle mellem motiv og domæne. Nedenstående infografik præsenterer forskellen mellem motiv og domæne i tabelform.
Oversigt – Motiv vs Domæne
Motif er et arrangement af sekundære strukturer af proteinmolekylet. Det er norm alt ikke stabilt i sig selv, i modsætning til et domæne. Domæne er en uafhængigt stabil struktur af et protein. Derfor kan det være en del af eller et helt proteinmolekyle. Det er en tredimensionel fundamental funktionel enhed af proteinet. Desuden har den en funktion, og den er en selvstændig enhed. Motiv kan være en del af domænet. Men domæne kan ikke være en del af et motiv. Dette er forskellen mellem motiv og domæne.
