Nøgleforskellen mellem proteinunderenhed og domæne er, at en proteinunderenhed er en separat polypeptidkæde af et protein, der samles med andre polypeptidkæder for at danne et proteinkompleks, mens et proteindomæne er en sammenhængende region af polypeptidkæden af et protein, der hyppigt folder uafhængigt til en kompakt, lokal og semi-uafhængig enhed.
Proteinunderenhed og domæne er meget vigtige dele af et multimert protein. Proteiner er polymerer fremstillet af polypeptider. Hver polypeptidkæde opbygges fra en monomer kendt som en aminosyre. Et komplekst protein indeholder distinkte strukturelle enheder såsom underenheder, domæner, motiv og fold. Disse strukturelle enheder af et komplekst protein er ekstremt vigtige for dets struktur og i sidste ende for dets funktion.
Hvad er en proteinunderenhed?
En proteinunderenhed er en separat polypeptidkæde af et protein, der samles med andre polypeptidkæder for at danne et proteinkompleks. I strukturel biologi er en proteinunderenhed et enkelt proteinmolekyle, der samles med andre proteinmolekyler for at danne et proteinkompleks. Naturligt forekommende proteiner har et relativt lille antal underenheder, såsom hæmoglobin og DNA-polymerase. Derfor kaldes de oligomere. Andre proteiner består af et stort antal underenheder, så de beskrives som multimere. For eksempel er mikrotubuli og andre cytoskeletproteiner multimere. Underenhederne af multimert protein kan være identiske (homologe) eller fuldstændigt forskellige (heterologe).
Figur 01: Proteinunderenhed
I nogle multimere proteiner kan en underenhed være en katalytisk underenhed. På den anden side er den anden en regulatorisk underenhed. Funktionen af den katalytiske underenhed er at katalysere den enzymatiske reaktion, hvorimod funktionen af den regulatoriske underenhed letter eller hæmmer dens aktivitet. Et enzym, der består af både katalytiske og regulatoriske underenheder, når det er samlet, omtales norm alt som et holoenzym. For eksempel har enzymklasse I phosphoinositide 3-kinase en p110 katalytisk underenhed og en p85 regulatorisk underenhed. Desuden skal et protein have ét gen for hver underenhed. Dette skyldes, at en underenhed består af en separat polypeptidkæde, der har ét kodende gen.
Hvad er et proteindomæne?
Et proteindomæne er en sammenhængende region af polypeptidkæden i et protein, der hyppigt folder uafhængigt til en kompakt, lokal og semi-uafhængig enhed. Et proteins domæne er også kendt som en region af polypeptidkæden af protein, der er selvstabiliserende og folder uafhængigt af resten. De er en distinkt strukturel og funktionel enhed i et protein. Norm alt er domæner ansvarlige for en specifik funktion eller en interaktion, der bidrager til proteinets overordnede rolle. For eksempel er SH3-domænet omkring 50 aminosyrerester. De forekommer i en bred vifte af proteiner, herunder adapterproteiner, phophatidylinositol3-kinaser, phospholipaser og myosiner. Disse SH3-domæner er involveret i protein-protein-interaktioner.
Figur 02: Proteindomæner
Domænerne varierer i længde fra 50 aminosyrer til 250 aminosyrer. De korteste domæner, såsom zinkfinger, stabiliseres af metalioner og disulfidbroer. Et domæne producerer ofte funktionelle enheder såsom det calciumbindende EF-hånddomæne af calmodulin. Ydermere kan domæner byttes gennem genteknologi mellem et protein til et andet for at lave kimære proteiner.
Hvad er lighederne mellem proteinunderenhed og domæne?
- Proteinunderenhed og domæne er strukturelle enheder af et multimert protein.
- Begge består af aminosyrer.
- De er forbundet med udtrykket "polypeptidkæde".
- Desuden er de begge ekstremt vigtige for proteinets overordnede funktion.
Hvad er forskellen mellem proteinunderenhed og domæne?
En proteinunderenhed er en separat polypeptidkæde af et protein, der samles med andre polypeptidkæder for at danne et proteinkompleks. På den anden side er et proteindomæne en sammenhængende region af polypeptidkæden af et protein, der hyppigt folder uafhængigt til en kompakt, lokal og semi-uafhængig enhed. Så dette er den vigtigste forskel mellem proteinunderenhed og domæne. Desuden er en proteinunderenhed større i størrelse end et proteindomæne.
Den følgende tabel opsummerer forskellen mellem proteinunderenhed og domæne i tabelform.
Oversigt – Proteinunderenhed vs domæne
Byggestenene i proteiner er aminosyrer. Proteiner dannes ved kondensering af aminosyrer. Proteinstrukturer varierer i størrelse fra ti til flere tusinde aminosyrer. En proteinstruktur stabiliseres af ikke-kovalente interaktioner såsom hydrogenbindinger, ionbindinger, Van der Waals-kræfter, hydrofobe bindinger og kovalente interaktioner såsom disulfidbindinger. Et komplekst protein indeholder distinkte strukturelle enheder såsom underenheder, domæner, motiv og fold. En proteinunderenhed er en separat polypeptidkæde af et protein, der samles med andre polypeptidkæder for at danne et proteinkompleks. På den anden side er proteindomænet en region af polypeptidkæden af protein, der er selvstabiliserende og folder uafhængigt af resten. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem proteinunderenhed og domæne.
