Nøgleforskellen mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA er, at cellefrit DNA er forskellige former for DNA, der frit cirkulerer i blodet, mens cirkulerende tumor-DNA er det fragmenterede tumor-afledte DNA, der cirkulerer i blodet.
Cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA er to typer cirkulerende nukleinsyrer. Cirkulerende nukleinsyrer blev opdaget af Mandel og Metal i 1948. Senere blev det opdaget, at mængden af cirkulerende nukleinsyrer hos syge patienter er signifikant høj. Denne opdagelse blev først gjort i forhold til lupuspatienter. Desuden har cirkulerende nukleinsyrer en højere prognostisk værdi og kan bruges som en biomarkør til påvisning af forskellige sygdomme.
Hvad er cellefrit DNA?
Cellefrit DNA (Cf DNA) henviser til forskellige former for DNA, såsom cirkulerende tumor-DNA, cellefrit mitokondrie-DNA og cellefrit føt alt DNA, osv., der frit cirkulerer i blodet. De forhøjede niveauer af cellefrit DNA observeres ved fremskredne sygdomme som cancer, traumer, sepsis, myokardieinfarkt, diabetes, slagtilfælde, seglcellesygdom osv. Ud over cancer og fostermedicin er cellefrit DNA en nyttig biomarkør for en mange lidelser. Dette DNA kan også bruges til at detektere transplantattransplantatafstødning. De bruges også til at bestemme almindelig stress, prænatal kønsskønnelse og til faderskabstest.
Figur 01: Cellefrit DNA
Et cellefrit DNA er norm alt et dobbeltstrenget ekstracellulært DNA-molekyle. Den består af små fragmenter (50 til 200 bp) og større fragmenter (21 kb). Desuden er det allerede blevet anerkendt som en pålidelig biomarkør til diagnosticering af prostata- og brystkræft. Cellefrit DNA cirkulerer overvejende i blodbanen som nukleosomer. Nukleosomer er nukleare komplekser af histoner og DNA. Cf DNA kan kvantificeres ved hjælp af forskellige teknikker såsom PCR, massivt parallel sekventering, ultraviolet spektrometri, PicoGreen farvning og ELISA. Da Cf DNA-detektion i blodbanen er en hurtig, nem, ikke-invasiv, repetitiv metode, vil den i fremtiden være en potentiel biomarkør til diagnosticering af adskillige sygdomme som autoimmune gigtsygdomme og tumorer.
Hvad er cirkulerende tumor-DNA?
Cirkulerende tumor-DNA (Ct-DNA) er det fragmenterede tumor-afledte DNA, der cirkulerer i blodet. Det har en tumor oprindelse. Da en cirkulerende tumor kan afspejle hele tumorgenomet, har den vundet bred tiltrækning for sin potentielle anvendelighed i kliniske opstillinger. Flydende biopsier, som udtager blod, kan bruges til at teste cirkulerende tumorer.
Figur 02: Cirkulerende tumor-DNA
De biologiske processer, der sandsynligvis er involveret i frigivelse af Ct-DNA, omfatter apoptose og nekrose fra døende celler eller aktiv frigivelse fra tumorceller. I sundt væv kan infiltrerende fagocytter rense Ct-DNA. Desuden kan forskellige teknikker bruges til at analysere cirkulerende tumor-DNA, såsom dråbe digital PCR, BEAMing, CAPP-Seq (dyb sekventering), sikker sekventering og dupleks sekventering.
Hvad er lighederne mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA?
- Cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA er to typer cirkulerende nukleinsyrer.
- De består af nukleotider.
- Begge typer kan bruges som potentielle markører til at diagnosticere forskellige sygdomme i kliniske opstillinger.
- De findes i blodbanen.
- Begge er ekstracellulære former for DNA-molekyler.
- De bliver begge ryddet op af infiltrerende fagocytter.
Hvad er forskellen mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA?
Cellefrit DNA er forskellige former for DNA såsom cirkulerende tumor-DNA, cellefrit mitokondrie-DNA og cellefrit føt alt DNA, osv., der frit cirkulerer i blodet, mens cirkulerende tumor-DNA er det fragmenterede tumor-afledte DNA der cirkulerer i blodet. Så dette er den vigtigste forskel mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA. Endvidere cirkulerer cellefrit DNA i fragmenter i området fra 50-220 bp, mens cirkulerende tumor-DNA cirkulerer i fragmenter i området fra 134-144 bp.
Den følgende infografik viser forskellen mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Cellefrit DNA vs cirkulerende tumor-DNA
Cirkulerende nukleinsyrer kastes ud i blodbanen gennem regulerede eller tilfældige mekanismer. Cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA er to typer cirkulerende nukleinsyrer. Cellefrit DNA er forskellige former for DNA såsom cirkulerende tumor-DNA, cellefrit mitokondrielt DNA, cellefrit føt alt DNA, der frit cirkulerer i blodet, mens cirkulerende tumor-DNA er det fragmenterede tumorafledte DNA, der cirkulerer i blodet. Dette opsummerer således forskellen mellem cellefrit DNA og cirkulerende tumor-DNA.
