Nøgleforskellen mellem phycocyanin og allophycocyanin er, at phycocyanin absorberer og udsender ved kortere bølgelængder end allophycocyanin.
Phycobiliproteiner er en familie af vandopløselige proteiner, der er til stede i cyanobakterier og visse algearter. Phycocyanin og allophycocyanin er to hovedmedlemmer af denne familie.
Hvad er Phycocyanin?
Phycocyanin er et pigment-proteinkompleks fra familien af lys-høstende phycobiliprotein. Andre vigtige medlemmer af denne familie omfatter allophycocyanin og phycoerythrin. Dette pigment er et tilbehørspigment til klorofyl. Generelt er alle phycobiliproteiner vandopløselige komplekser, der ikke kan eksistere i membranerne som carotenoider. I stedet for at eksistere i membraner har disse pigmenter en tendens til at aggregere og danne klynger, der kan klæbe til membranerne kendt som phycobilisomes.
Figur 01: Ekstraherede Phycocyanin-pigmenter (fra cyanobakterier)
Vi kan observere, at Phycocyanin har en karakteristisk lyseblå farve, der kan absorbere orange og rødt lys (nær 620 nm) og kan udsende fluorescens (omkring 650 nm). Vi kan finde dette farvepigment i cyanobakterier, og navnet "Phycocyanin" kommer fra den græske betydning for "Phyco", som refererer til "alger" og suffikset "cyanin" fra græsk betydning for "Kyanos", som refererer til "mørkeblå".
Phycocyanin-molekyler deler typisk en fælles struktur med alle phycobiliproteiner. Når man overvejer strukturen af dette pigment, begynder det med samlingen af phycobiliproteinmonomerer. Disse monomerer er heterodimerer bestående af alfa- og beta-underenheder med deres respektive kromoforer. Kromoforerne og underenhederne er forbundet gennem en kemisk thioetherbinding.
Underenhederne af Phycocyanin-strukturen indeholder typisk otte alfa-helixer. Monomerstrukturerne har en tendens til spontant at aggregere og danne ringformede trimere med rotationssymmetri og en central kanal. Desuden har trimererne en tendens til at aggregere i par og danne hexamerer, der assisteres med yderligere linkerproteiner. Derfor indeholder hver phycobilisome stav to eller flere Phycocyanin hexamerer.
Hvad er Allophycocyanin?
Allophycocyanin er et proteinmolekyle, der kommer fra phycobiliprotein-familien, og det er et tilbehørspigment til klorofyl. De andre medlemmer af denne lys-høstende phycobiliprotein-familie inkluderer Phycocyanin, phycoerythrin og phycoerythrocyanin. Allophycocyaninpigmenter kan absorbere og udsende rødt lys, og vi kan let finde dette pigment i cyanobakterier og rødalger.
Figur 02: Allophycocyanins udseende i et diagram
Vi kan isolere allophycocyanin fra forskellige arter af røde eller blågrønne alger. Disse alger producerer lidt forskellige former for molekylet. Generelt indeholder allophycocyanin-molekylet to forskellige underenheder benævnt alfa- og beta-underenhed. Hver underenhed har én phycocyanobilin-kromofor.
Der er forskellige anvendelser af allophycocyanin; mange instrumenter er blevet udviklet specifikt til allophycocyanin. For eksempel er denne komponent almindeligt anvendt i immunoassays, herunder FACS, flowcytometri osv.
Hvad er lighederne mellem Phycocyanin og Allophycocyanin?
- Phycocyanin og allophycocyanin er vandopløselige proteiner
- Begge er inkluderet i phycobiliprotein-familien.
Hvad er forskellen mellem Phycocyanin og Allophycocyanin?
Phycobiliproteiner er en familie af vandopløselige proteiner, der er til stede i cyanobakterier og visse algearter. Phycocyanin og allophycocyanin er to hovedmedlemmer af denne familie. Den vigtigste forskel mellem phycocyanin og allophycocyanin er, at Phycocyanin absorberer og udsender ved kortere bølgelængder end allophycocyanin.
Infografikken nedenfor viser flere forskelle mellem phycocyanin og allophycocyanin i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – Phycocyanin vs Allophycocyanin
Phycobiliproteiner er en familie af vandopløselige proteiner, der er til stede i cyanobakterier og visse algearter. Phycocyanin og allophycocyanin er to hovedmedlemmer af denne familie. Den vigtigste forskel mellem Phycocyanin og allophycocyanin er, at Phycocyanin absorberer og udsender ved kortere bølgelængder end allophycocyanin.
