Nøgleforskellen mellem sammensatte transposoner og IS-elementer er, at sammensatte transposoner er en type transposoner, der bærer accessoriske gener, såsom antibiotikaresistensgener, mens IS-elementer (eller Insertion Sequence-elementer) er transponerbare elementer, der kun bærer gener, som kodetransposase, der katalyserer transponeringsaktiviteten.
Et transposon er et fragment af DNA, der kan ændre sin position i bakteriegenomet. Derfor er de mobile DNA-sekvenser. De bevæger sig ind i nye placeringer af genomet og foretager ændringer i sekvensen af det bakterielle genom, hvilket forårsager betydelige ændringer i genetisk information. Transposoner er også kendt som springgener, da de kan blokere transskriptionen af gener og omarrangere bakteriens genetiske materiale. Desuden er de ansvarlige for bevægelsen af lægemiddelresistens, antibiotikaresistensgener mellem plasmider og kromosomer. Sammensatte transposoner og IS-elementer er to typer mobile genetiske elementer, der findes i bakterier. Begge kan flytte fra et sted til et andet i genomet.
Hvad er sammensatte transposoner?
En sammensat transposon er et segment af DNA flankeret af to kopier af lignende insertionssekvenselementer. Der er en central proteinkodende region i sammensat transposon. Generne er ofte antibiotika-resistente gener. De kan også indeholde kataboliske gener. Desuden består sammensat transposon af to omvendte gentagelser. Hele længden af den sammensatte transposon bevæger sig som én komplet enhed.
Figur 01: Composite Transposon
Tn10 er en sammensat transposon. Den består af en 6,5 kb central kodende region (tetracyclin-resistent gen) og 1,4 kb inverterede insertionssekvenselementer i hver ende. IS-elementer leverer transposase. Transposase er et enzym, der katalyserer transposonets bevægelse. Sammensatte transposoner kan amplificeres ved at designe primere til IS-elementer.
Hvad er IS-elementer?
Indsættelsessekvenselementer eller IS-elementer er en type mobilt genetisk element. De er en simpel form for transposoner. De bærer kun generne, der koder for transposase-enzymer. Transposase-enzymer katalyserer transpositionen af transposoner. Strukturelt er den kodende sekvens af IS-elementer flankeret af to omvendte gentagelser. For eksempel er IS-elementet kaldet IS911 flankeret af to 36bp omvendte gentagne ekstremiteter.
IS-elementer er de mest udbredte autonome transponerbare elementer i bakteriegenomet. Derfor er de ekstremt vigtige for prokaryot genomorganisation og evolution. Ydermere forekommer IS-elementer som dele af sammensatte transposoner. Generelt findes to IS-elementer, der flankerer den kodende sekvens af den sammensatte transposon. Men enhedstransposoner bærer ikke flankerende IS-elementer.
Da IS-elementer kan bevæge sig inden for genomet, kan de afbryde den kodende sekvens af andre gener og inaktivere generne ved at blokere ekspression.
Hvad er lighederne mellem sammensatte transposoner og IS-elementer?
- Både sammensatte transposoner og IS-elementer er i stand til at ændre positionen i bakteriegenomet.
- Kodningsområdet i begge transposoner er norm alt flankeret af omvendte gentagelser.
- En sammensat transposon er flankeret af to separate IS-elementer.
Hvad er forskellen mellem sammensatte transposoner og IS-elementer?
Kompositte transposoner er mobile genetiske elementer, der består af to insertionssekvenser (IS'er), der ofte flankerer et eller flere antibiotikaresistensgener. På den anden side er IS-elementer en type simpelt transposerbart element, der indeholder gener, der koder for transposase-enzym for at katalysere transposition. Så dette er den vigtigste forskel mellem sammensatte transposoner og IS-elementer.
Nedenfor er en liste over forskelle mellem sammensatte transposoner og IS-elementer i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – sammensatte transposoner vs IS-elementer
Et bakteriel genom har genetiske elementer, der er mobile. Sammensatte transposoner og IS-elementer er to typer mobile genetiske elementer. Sammensatte transposoner bærer antibiotika-resistente gener og flankerende IS-elementer. IS-elementer bærer den genetiske kode til at producere transposase, som katalyserer bevægelsen af transposoner. Dette er således den vigtigste forskel mellem sammensatte transposoner og IS-elementer.
