Nøgleforskellen mellem DNA-transposoner og retrotransposoner er, at DNA-transposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en klip- og indsætmekanisme, mens retrotransposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra ét sted til en anden i genomet ved at bruge copy and paste-mekanisme.
Mobile genetiske elementer (MGE'er) er segmenter af DNA, der koder for specifikke enzymer og proteiner, der medierer deres bevægelse i genomet, eller som kan overføres fra en art til en anden. De er også kendt som egoistiske genetiske elementer. Transponerbare elementer repræsenterer en af flere typer mobile genetiske elementer. Der er to hovedtyper af transposerbare elementer: DNA-transposoner og retrotransposoner. Derfor er DNA-transposoner og retrotransposoner mobile genetiske elementer, der kan bevæge sig fra sted til sted i genomet.
Hvad er DNA-transposoner?
DNA-transposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en klip- og indsætmekanisme. De tilhører klasse II transponerbare elementer, der bevæger sig gennem et DNA-mellemprodukt. Dette er i modsætning til klasse I transposerbare elementer (retrotransposoner), der bevæger sig gennem et RNA-mellemprodukt. Norm alt bevæger DNA-transposoner sig rundt i genomet ved at bruge en cut and paste-metode. Denne metode kræver et transposase-enzym, der katalyserer bevægelsen af DNA'et fra dets nuværende placering i genomet og indsættelse i den nye placering.
Figur 01: DNA-transposoner
Denne transposition kræver tre DNA-steder på transposonet (to i hver ende af transposonet kaldet terminale inverterede gentagelser og et ved målstedet). Transposase-enzymet vil binde til de terminale inverterede gentagelser af transposonet og medierer synapsis af transposon-enderne. Derefter afbryder transposase-enzymet elementet fra det flankerende DNA fra det oprindelige donorsted og medierer sammenføjningen af transposonet til det nye insertionssted i genomet. Tilføjelsen af transposon til den nye placering forårsager korte mellemrum på hver side af det indsatte segment. Værtssystemer reparerer disse huller, hvilket resulterer i målsekvensduplikering (TSD), som er karakteristisk for transposition.
Hvad er retrotransposoner?
Retrotransposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en kopi- og indsæt-mekanisme. De tilhører klasse I transponerbare elementer. Klasse I-transposerbare elementer (retrotransposoner) bevæger sig gennem et RNA-mellemprodukt i genomet. De er en type genetisk komponent, der kopierer og indsætter sig selv på forskellige genomiske steder.
Figur 02: Retrotransposoner
Først transskriberes de fra DNA til RNA. Derefter bliver det producerede RNA omvendt transskriberet til DNA. Dette kopierede DNA indsættes senere tilbage i genomet på et nyt sted. Den omvendte transkription katalyseres af revers transkriptase. Revers transkriptase kodes ofte af retrotransposon selv. Integrationen udføres af et enzym kaldet integrase. Desuden er der almindeligvis tre typer: lange terminale gentagelser (LTR), lange interspersed nukleare elementer (LINE) og korte interspersed nukleare elementer (SINE).
Hvad er lighederne mellem DNA-transposoner og retrotransposoner?
- DNA-transposoner og retrotransposoner er mobile genetiske elementer.
- Begge er klassificeret under transponerbare elementer.
- Begge er kendt som springgener.
- De kan bevæge sig fra sted til sted i genomet.
- De er evolutionære meget vigtige.
Hvad er forskellen mellem DNA-transposoner og retrotransposoner?
DNA-transposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en klippe- og indsætmekanisme, mens retrotransposoner er mobile genetiske elementer, der bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en kopi og pasta mekanisme. Dette er således den vigtigste forskel mellem DNA-transposoner og retrotransposoner. Desuden hører DNA-transposoner til klasse II transposerbare elementer, mens retrotransposoner tilhører klasse I transposerbare elementer.
Nedenstående infografik præsenterer forskellene mellem DNA-transposoner og retrotransposoner i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – DNA-transposoner vs retrotransposoner
DNA-transposoner og retrotransposoner er mobile genetiske elementer. DNA-transposoner bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en cut-paste-mekanisme. Retrotransposoner bevæger sig fra et sted til et andet i genomet ved at bruge en kopi- og indsæt-mekanisme. Så dette opsummerer forskellen mellem DNA-transposoner og retrotransposoner.
