Nøgleforskellen mellem konserveret og konsensussekvens er, at konserveret sekvens refererer til lignende sekvenser af nukleinsyrer eller aminosyrer, der forekommer i forskellige eller samme arter over generationer, mens konsensussekvens er en almindeligt forekommende nukleotidsekvens eller aminosyresekvens fundet i et stærkt konserveret område af DNA eller RNA eller protein.
Organismer deler lignende og forskellige egenskaber. Når man studerer forholdet mellem organismer og klassificerer dem, er genom eller genetisk sammensætning af organismer meget vigtig. Der er nogle nukleotid- eller aminosyresekvenser, som er almindelige blandt forskellige organismer. En konserveret sekvens er en nukleinsyre- eller aminosyresekvens, som er konsistent blandt arter. Derfor er de fylogenetisk vigtige, når de genererer fylogenetiske træer. I konserverede sekvenser er der specifikke nukleotidsekvenser, der er mere almindeligt forekommende. De er kendt som konsensussekvenser.
Hvad er bevaret sekvens?
En konserveret sekvens er en nukleinsyresekvens eller aminosyresekvens, der er ens blandt arter. Derfor er den konsistent på tværs af arten gennem evolutionen. Generelt opretholdes disse sekvenser ved naturlig selektion. De forbliver uændrede langt tilbage i det fylogenetiske træ. Derfor er konserverede sekvenser vigtige ved konstruktion af fylogenetiske træer. Det menes, at meget konserverede sekvenser ofte har en vigtig funktionel værdi. De er også nyttige til at identificere genetiske sygdomme. Konserverede sekvenser kan imidlertid være kodende eller ikke-kodende nukleinsyresekvenser. Derudover viser konserverede sekvenser langsommere mutationshastigheder. Derfor viser de meget minimale ændringer i deres sammensætning; nogle gange viser de ikke ændringer gennem generationerne.
Figur 01: Bevaret sekvens
RNA-komponenter af ribosomer er til stede i alle livets domæner, homeobox-sekvenserne i eukaryoter og tmRNA'et i bakterier er flere eksempler på meget konserverede sekvenser. Identifikation af konserverede sekvenser er let, når bioinformatiske tilgange, især sekvensjusteringsværktøjet, anvendes. Desuden letter multiple sekvensjustering visualiseringen af konserverede sekvenser.
Hvad er konsensussekvens?
En konsensussekvens er en sekvens, der almindeligvis findes i en given konserveret region af DNA eller RNA. Det er en meget specifik nukleotidsekvens. Som et eksempel er der en konsensussekvens ved -10 som TATAAT (Pribnow-boks) i E. coli-promotorer, som er stærkt konserverede sekvenser. På samme måde er der en anden konsensussekvens: TTGACA i E. coli-promotorer ved -35. Konsensussekvenser er også kendt som "kasser".
Figur 02: Konsensussekvens
Ud over DNA og RNA har proteiner også konsensussekvenser af aminosyrer. Proteinbindingssteder er ofte repræsenteret ved konsensussekvenser. Restriktionsenzymer har også konsensussekvenser. Desuden er splejsningssteder også konsensussekvenser. I lighed med konserverede sekvenser kan konsensussekvenser beregnes og visualiseres ved hjælp af bioinformatiske værktøjer.
Hvad er lighederne mellem konserveret og konsensussekvens?
- Konserverede og konsensussekvenser er nukleinsyre- eller aminosyresekvenser, som er fælles på tværs af arter.
- Både konserverede sekvenser og konsensussekvenser kan visualiseres med bioinformatikværktøjer.
- De er meget udbredt i molekylærbiologi.
Hvad er forskellen mellem konserveret og konsensussekvens?
Den konserverede sekvens er en nukleinsyre- eller aminosyresekvens, som er konsistent blandt arter, mens konsensussekvenser er meget specifikke og almindeligt forekommende baser eller aminosyrer i en given konserveret region. Så dette er den vigtigste forskel mellem konserveret og konsensussekvens. Desuden er en anden forskel mellem konserveret og konsensussekvens, at de konserverede sekvenser er fylogenetisk vigtige, mens konsensussekvenser ofte er proteinbindingssteder, splejsningssteder, restriktionsenzymskæringssteder osv.
Opsummering – Konserveret vs. konsensussekvens
Konserverede sekvenser er sekvenserne af nukleinsyrer eller proteiner, der ligner hinanden blandt levende arter. En promotor, ribosombindingssted, et replikationsorigin og aminosyresekvens af histonprotein er flere eksempler på konserverede sekvenser. I modsætning hertil er konsensussekvenser specifikke baser eller aminosyrer, som oftere findes i en given konserveret sekvens. -10 box, -35 box of E. coli promotor, proteinbindingssteder, splejsningssteder og restriktionsenzymer genkendende sites er adskillige eksempler på konsensussekvenser. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem konserveret og konsensussekvens.
