Nøgleforskellen mellem wobble og degeneration er, at wobble refererer til den hypotese, der forklarer ikke-Watson- og crick-parringen under codon- og anticodonbinding mellem mRNA og tRNA. I mellemtiden er degenerationen af kodonet evnen til at producere en enkelt aminosyre fra flere kodoner.
Molekylærbiologiens centrale dogme forklarer den proces, hvori ekspressionen af funktionelle proteiner finder sted. Og denne proces er en sekvens af forskellige trin, herunder replikationen af det genetiske materiale efterfulgt af transkriptionen af DNA-sekvensen til mRNA-sekvensen og translation af mRNA-sekvensen til en aminosyresekvens.
I oversættelse spiller begreberne wobble-hypotesen og degenerationen af codonet vigtige roller. Wobble refererer til enkelt tRNA's evne til at genkende mere end ét kodon. Det giver anledning til degeneration af kodoner. Degeneration er det fænomen, hvor én aminosyre kan specificeres af mere end én kodon. Med enkle ord refererer degeneration til eksistensen af flere koder for en enkelt aminosyre.
Hvad er Wobble?
Wobble-hypotesen er en vigtig hypotese, der forklarer den ikke-Watson Crick-baseparring, der finder sted under oversættelsesprocessen. Her er translationen den molekylære proces, der omdanner mRNA-kodonet til en aminosyresekvens. Ifølge denne hypotese er den første base af tRNA-antikodonet i stand til at parre med den tredje base af kodonet i mRNA-strengen ved ikke-Watson og Crick-parringsmønster. De følger således ikke de konventionelle adenin-uracil-bindingsmønstre eller cytosin-guanin-bindingsmønstre. Det er kendt som slingringsmønsteret for antikodonets base 1 og codonets base 3.
Figur 01: Wobble Base Pairing
Wobble-parringerne inkluderer adenin- og inosin-parring i stedet for uracil. Uracil parrer sig med adenin, guanin og inosin. Ligeledes er guanin og cytosin også i stand til at parre sig med inosin. Inosin i tRNA er således en af de usædvanlige baser, der undergår slingrebaseparring.
Wobble baseparbindingen er mindre stærk, da den ikke nødvendigvis følger Watson og Cricks komplementære binding. Desuden giver dette koncept anledning til princippet om degeneration af den genetiske kode.
Hvad er degeneration?
Degeneration af den genetiske kode refererer til redundansen af den genetiske kode. Der kan således være mange baseparkombinationer, der specificerer en enkelt aminosyre. Generelt består organismens kodon af tre nukleotidbaser. I begrebet degeneration kan disse tre basekombinationer ændre sig, selvom de giver anledning til den samme aminosyre. Desuden er der mere end 20 kodoner, selvom der kun er 20 aminosyrer i naturen. Derfor forklarer degeneration eksistensen af flere kodoner for en specifik aminosyre.
Figur 02: Degeneration
I degeneration kan den tredje base skifte mellem to kodoner. Således er glutaminsyre specificeret af både kodonerne GAA og GAG, mens leucin er specificeret af kodonerne UUA, UUG, CUU, CUC, CUA og CUG.
Derfor er begrebet degeneration meget vigtigt i mutationsrater. På grund af dette kan punktmutationer, der finder sted i genomet, tolereres og stadig synes at være dæmpet. Denne type punktmutationer resulterer således ikke i en mutation eller ændring af aminosyresekvensen. Men hvis punktmutationerne fører til en ændring af den kodede aminosyre, kan det forårsage alvorlige genotypiske og fænotypiske ændringer.
Hvad er lighederne mellem wobble og degeneration?
- Begge er vigtige hypoteser, der fremsættes for at forklare livets centrale dogme i forhold til oversættelsesprocessen.
- Yderligere spiller begge processer en vigtig rolle i oversættelsen af det tre basepars kodonsprog til 20 aminosyresekvensen.
- Disse processer hjælper også organismernes evolutionære mønstre.
Hvad er forskellen mellem vaklen og degeneration?
Nøgleforskellen mellem wobble og degeneration er primært det faktum, at wobbling resulterer i degeneration af den genetiske kode. Wobbling refererer til følgningen af ikke-Watson og Crick-parring mellem kodonens 3rd base og antikodonens 1st base. I modsætning hertil er degeneration mange tripletkodonkombinationers evne til at kode for en enkelt aminosyre.
Nedenstående infografik opsummerer forskellen mellem vaklen og degeneration.
Opsummering – Wobble vs Degeneracy
Wobble-hypotese og degeneration af den genetiske kode er to vigtige begreber i fænomenet oversættelse. Her er oversættelsen processen med at omdanne triplet-kodoner til aminosyrer. I bindingen af codonet til anticodonet refererer opdagelsen af non-Watson og Crick baseparring til wobble-hypotesen. Slingringen af baser mellem codon og anticodon beskrives herved. I modsætning hertil er degenerationen af den genetiske kode, der resulterer i slingreprocessen, det fænomen, hvor en enkelt aminosyre er kodet af mange forskellige kodoner. Så dette er opsummeringen af forskellen mellem vaklen og degeneration.
