Nøgleforskellen mellem protomerer og capsomerer er, at protomerer er strukturelle enheder af oligomere proteiner, mens capsomerer er individuelle proteiner sammensat af protomerer, som er strukturelle underenheder af det virale capside.
En virus er en intracellulær obligat parasit, som er en infektiøs partikel. Capsiden er en af de to hovedkomponenter i en viruspartikel. Det er en proteinkappe, der omgiver og beskytter det virale genom. Et capsid består af protomerer, som er de strukturelle enheder af oligomere proteiner. Capsomere er en strukturel underenhed af det virale capside, og det er en aggregering af flere protomerer som en enhed. Således samler protomerer sig selv for at danne en capsomer, og capsomerer samler sig selv for at danne en capsid.
Hvad er Protomers?
Protomerer er de strukturelle enheder af oligomere proteiner. Protomer indeholder mindst to forskellige polypeptidkæder. Oftere indeholder de flere polypeptider. I virale capsider samler protomerer sig selv for at danne capsomerer, som er de morfologiske enheder af capsider. Protomere forbinder med hinanden via specifikke bindinger og samler sig selv.
Figur 01: Protomers
I tobaksmosaikviruset aggregeres protomerer for at danne en to-lags skive for at indhylle RNA-genomet. Således danner disse protomere af tobaksmosaikvirus endelig et langt stift hult rør, som giver det et spiralformet udseende. I icosaedrisk symmetri samler protomerer sig i enheder på fem eller seks capsomerer og kondenserer derefter til 20 flader af ligesidede trekanter og 20 spidser.
Hvad er Capsomeres?
Capsomerer er de strukturelle proteinunderenheder af det virale kapsid. De er også de morfologiske underenheder af vira. Strukturelt er capsidet en samling af capsomerer. Hver capsomere har flere protomerer, der er selvmonteret med hinanden. Desuden er capsomerer arrangeret anderledes i capsidet for at give en form til det virale capside. I denne henseende er spiralformet, icosaedrisk og kompleks de tre typer af capsomere arrangementer i vira. Arrangementet af capsomerer er imidlertid karakteristisk for en bestemt virus. Capsomerer forbindes med hinanden via intercapsomere triplekser bestående af to kopier af et protein og en kopi af et andet.
Figur 02: Capsomeres
Yderligere har hver virus et begrænset antal capsomerer. Hepatitis B-virus har et icosahedral capsid, der indeholder 180 capsomerer. Rekombinant adenovirus har et capsid indeholdende 252 capsomerer. Herpesvirus har 162 capsomerer i deres capsider. Desuden har enterovirus 60 capsomerer i sin capsid. Ligeledes har forskellige vira et forskelligt antal capsomerer i deres proteinskal.
Capsomeres opfylder flere funktioner i vira. Capsomerer beskytter det virale genom mod fysiske, kemiske og enzymatiske skader. Desuden er capsomerer vigtige for at introducere et vir alt genom i værten ved at adsorbere let til værtscelleoverflader.
Hvad er lighederne mellem protomerer og capsomerer?
- Protomerer og capsomerer er proteinstrukturer.
- Protomerer er underenheder af capsomerer, mens capsomerer er underenheder af det virale capsid.
- Både protomerer og capsomerer kan samles selv.
Hvad er forskellen mellem protomerer og capsomerer?
Protomerer er de strukturelle enheder, der laver oligomere proteiner, mens capsomerer er de morfologiske enheder af virale capsider. Så dette er den vigtigste forskel mellem protomerer og capsomerer. Desuden aggregerer protomerer for at danne capsomerer, mens capsomerer aggregerer for at danne capsid.
Infografikken nedenfor opsummerer forskellen mellem protomerer og capsomerer.
Opsummering – Protomers vs Capsomeres
Protomerer er underenheder af capsomerer, mens capsomerer er proteinunderenheder af det virale capsid. Således er capsomere en aggregering af protomerer, mens capsid er en aggregering af capsomerer. Arrangement af protomerer eller arrangement af capsomerer giver form eller symmetri til en bestemt virus. Baseret på capsomere arrangement, spiralformet og icosahedral er to former eller symmetrier set i vira. Så dette opsummerer forskellen mellem protomerer og capsomerer.
