Nøgleforskellen mellem hastighedszone- og isopycnisk centrifugering er, at hastighedszonecentrifugering er vigtig ved adskillelse af partikler, der adskiller sig i størrelse, men ikke i deres tæthed, hvorimod isopycnisk centrifugering er vigtig ved adskillelse af partikler, der adskiller sig i tæthed, men ikke i deres størrelse.
Centrifugering er en analytisk teknik, vi kan bruge til at adskille partikler i en opløsning baseret på mediets størrelse, form, densitet, viskositet osv.. Her skal vi placere opløsningen indeholdende de suspenderede partikler i et centrifugalrør og derefter indsætte røret i rotoren for at rotere det med en defineret hastighed, så partiklerne bliver adskilt fra opløsningen.
Hvad er Rate Zonal Centrifugation?
Rate zonal centrifugering er en analytisk teknik, vi kan bruge til at adskille partikler af en opløsning afhængigt af størrelsen, men ikke af densiteten. Med andre ord adskiller denne teknik partiklerne fra en opløsning baseret på størrelsen, men den tager ikke hensyn til forskellene i partiklernes densitet. Derfor er denne teknik meget nyttig til at adskille cellulære organeller såsom endosomer. Desuden kan vi også bruge det til at adskille proteiner.
Figur 01: En bordcentrifuge
Denne centrifugering er desuden tidsafhængig. Dette betyder, at prøvens position er relateret til tidspunktet for sedimentering. Gradienten, vi opnår fra denne metode, er flad, og den maksimale tæthed af denne gradient overstiger aldrig densiteten af den maksim alt tætte partikel i pelleten.
Hvad er Isopycnic Centrifugation?
Isopycnic centrifugering er en analytisk teknik, vi kan bruge til at adskille partikler af en opløsning afhængigt af densiteten, men ikke af størrelsen. Det betyder; vi kan adskille partikler i en opløsning, hvis de er forskellige fra hinanden i deres tæthed. Hvis de adskiller sig i størrelse i stedet for tæthed, er denne teknik ikke egnet til den adskillelse. Størrelsen af partikler påvirker kun partiklernes migrationshastighed. Derfor er denne teknik uafhængig af tid.
Figur 02: Densitetsgradient givet af centrifugering
Vigtigere er det, vi kan bruge denne teknik til at adskille nukleinsyrer i en gradient. Gradienten givet ved isopycnisk centrifugering er stejl. Desuden producerer den ikke en pellet, fordi adskillelsen er baseret på partiklernes opdriftstæthed.
Hvad er forskellen mellem Rate Zonal og Isopycnic Centrifugation?
Nøgleforskellen mellem hastighedszone- og isopycnisk centrifugering er, at hastighedszonecentrifugering er vigtig ved adskillelse af partikler, der adskiller sig i størrelse, men ikke i deres tæthed, hvorimod den isopycniske centrifugering er vigtig ved adskillelse af partikler, der adskiller sig i tæthed, men ikke i deres størrelse.
Yderligere er en anden væsentlig forskel mellem hastighedszone- og isopycnisk centrifugering, at hastighedszonecentrifugering er tidsafhængig, mens den isopycniske centrifugering er uafhængig af tid. Desuden er gradienten givet af hastighedszonecentrifugeringen flad, mens den ved isopycnisk centrifugering er stejl.
Opsummering – Vurder Zonal vs Isopycnic Centrifugation
Centrifugering er en vigtig analytisk teknik. Der er to former for centrifugering, som vi bruger i biologiske applikationer: rate zone- og isopycnic centrifugering. Den vigtigste forskel mellem hastighedszone- og isopycnisk centrifugering er, at hastighedszonecentrifugering er vigtig til at adskille partikler, der adskiller sig i størrelse, men ikke i deres tæthed, hvorimod den isopycniske centrifugering er vigtig til at adskille partikler, der adskiller sig i tæthed, men ikke i deres størrelse.
