Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter i DNA, og der er store forskelle mellem dem. Den procentvise tilstedeværelse af disse genetiske materialer varierer på tværs af arter, og deres funktioner bestemmer organismens skæbne med mutationer og andre fænotypisk vigtige ændringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger af visse gener placeret i DNA-strengene, og ændringer af deres placering har været hovedårsagerne til disse konsekvenser. Denne artikel har dog til hensigt at diskutere disse geners funktioner kort og præsenterer en sammenligning mellem transposoner og retrotransposoner.
Hvad er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter af DNA med evnen til at ændre placeringen af DNA-strengen i form af klippe- og indsætmekanisme. På grund af denne mobile karakter af transposonerne er disse kendt som springgener. Transposoner er af to hovedtyper kendt som klasse I-transposoner og klasse II-transposoner. Norm alt omtales Klasse II-typen som transposonerne, og Klasse I-typen omtales som retrotransposonerne. Processerne med at skære og indsætte mobile DNA-segmenter reguleres af enzymet transposase. Enzymet binder til begge ender af transposonet og skærer phosphodiester-bindingerne af DNA-strengen, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder det nye sted. Denne proces er imidlertid interessant at forstå, da nogle transposoner kun kan flytte til bestemte steder på grund af inkompatibiliteten af basesekvenser med målstedet. Gener med den ene ende af en enkelt streng har den samme basesekvens med den anden ende af den anden enkeltstreng er transposoner med klæbrige kanter, fordi de kan binde til stederne af mål-DNA-strengen med den samme basesekvens som i de klæbrige ender. Imidlertid kan denne mobilitet af gener forårsage ændringer af genotypen såvel som i organismens fænotype. Forskere, der opfandt transposonerne, og genetisk modificerede fødevarer og organismer i henhold til de foretrukne tilpasninger blev derefter gjort tilgængelige. Højproduktive landbrugsafgrøder, antibiotika med medicinske egenskaber, husdyr var nogle af de fordelagtigt udviklede produkter efter Barbara McClintocks opfindelse af transposoner i 1940'erne.
Hvad er retrotransposon?
Retrotransposoner er Klasse I-transposonerne, og disse bevæger sig gennem genomet gennem mekanismen med kopiering og indsæt. Mekanismen for retrotransposoners mobilitet involverer få store trin, såsom kopiering af gensegmentet af DNA-strengen til RNA, overførsel af kopien af RNA til målstedet, transkription af RNA-sekvensen tilbage til DNA ved hjælp af revers transkriptase og insertion af genet ind i den nye placering af genomets DNA-streng. De to ender af disse retrotransposoner har sædvanligvis lange terminale gentagelser med omkring 1000 basepar, og de bruges som identifikationstræk for disse gener. Disse gener amplificeres let inde i genomet, og procentdelen af retrotransposonerne i det menneskelige genom er omkring 50%. Disse kan være ret farlige, da den forårsagende virus af AIDS, HIV og T-celle leukæmivirus har retrotransposonerne i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse vira binde retrotransposonerne til et hvilket som helst sted i de humane DNA-strenge ved brug af revers transkriptase og integrase. Integrase-enzymet fungerer på samme måde som transposase i klasse II-transposoner.
Hvad er forskellen mellem Transposon og Retrotransposon?
• Transposoner er klasse II-springgener, mens retrotransposoner falder i kategorien klasse I.
• Transposoner fungerer med transposase-enzymet, hvorimod retrotransposoner fungerer ved brug af to hovedenzymer kendt som revers transkriptase og integrase.
• De terminale ender er meget længere i retrotransposoner end i transposoner.
• Transposoner klippes fra oprindelsen og indsættes ved målet; omvendt kopieres retrotransposoner fra oprindelsen til RNA og transskriberes ved målet.
• Flytning af retrotransposoner involverer RNA, men ikke i transposoner.
