Nøgleforskellen mellem snRNA og snoRNA er, at snRNA involverer alternativ splejsning af præ-mRNA, mens snoRNA involverer modifikation af rRNA og tRNA, mRNA-redigering og genomprægning.
Lille RNA er polymere RNA-molekyler, der består af mindre end 200 nukleotider. De er norm alt ikke-kodende. De findes blandt messenger-RNA'er for at bære signaler. Små RNA'er stammer fra perfekt dobbeltstrenget RNA, som produceres ved virkningen af RNA-afhængig RNA-polymerase. Små RNA'er spiller en vigtig rolle i celledifferentiering, vækst og proliferation, apoptose, metabolisme, migration og forsvar. Derfor er små RNA'er vigtige og kritiske regulatorer af udvikling og fysiologi. Lille nukleært RNA og lille nukleolært RNA er to klasser af små RNA-molekyler.
Hvad er snRNA?
Lille kerne-RNA eller snRNA er en klasse af små RNA-molekyler, der findes i kernen af eukaryote celler. Den gennemsnitlige længde af et snRNA er cirka 150 nukleotider. RNA-polymerase II eller RNA-polymerase III transskriberer snRNA. Hovedfunktionen af snRNA er behandlingen af præ-budbringer-RNA i kernen. De hjælper også med at regulere transkriptionsfaktorer eller RNA-polymerase II og opretholde telomerer.
Figur 01: Virkningsmekanisme for lille RNA
Der er to klasser af snRNA baseret på fælles sekvenstræk og associerede proteinfaktorer såsom RNA-bindende LSm-protein. De to klasser er Sm-klasse snRNA og Lsm-klasse snRNA. Sm-klasse snRNA består af højt uridinindhold af U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 og U12. RNA polymerase II transkriberer SM-klasse snRNA. Efter transkriptionen af præ-snRNA modtager de norm alt en 7-methylguanosin 5'-hætte i kernen. Derefter eksporteres de til cytoplasmaet gennem nukleare porer til videre bearbejdning. Lsm-klasse snRNA har et højt uridinindhold af U6 og U6atac. RNA-polymerase III transkriberer Lsm-klasse snRNA, og det forlader ikke kernen. De mest almindelige humane snRNA-komponenter er U1 spliceosomal RNA, U2 spliceosomal RNA, U4 spliceosomal RNA, U5 spliceosomal RNA og U6 spliceosomal RNA.
Hvad er snoRNA?
Lille nukleolært RNA eller snoRNA er en klasse af små RNA-molekyler, der styrer kemiske modifikationer i andet RNA, såsom ribosom alt RNA, transfer-RNA og lille nuklear RNA. Hvert snoRNA-molekyle er forbundet med omkring fire kerneproteiner i RNA/protein-komplekset under modifikationsprocessen. snoRNA'et indeholder et antisense-element, som er omkring 10-20 nukleotider. Disse baser er komplementære til sekvensen, der omgiver nukleotiderne, der er målrettet mod modifikationen i præ-RNA-molekylet.
Figur 02: Lille nukleolært RNA
Der er to klasser af snoRNA'er. De er C/D box snoRNA og H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA er forbundet med methylering, og H/ACA box snoRNA er forbundet med pseudo-uridylering. Hvert snoRNA-molekyle fungerer som en guide for en eller to modifikationer i et mål-RNA. C/D box snoRNA indeholder to korte konserverede sekvensmotiver C og D, nær henholdsvis 5' og 3' enderne af snoRNA'et. Korte regioner bestående af 5 nukleotider arrangeres opstrøms for C-boksen og nedstrøms for D-boksen og danner en stamkasse-struktur. Dette bringer C- og D-boksmotiverne tæt på hinanden. Stamkassestruktur er vigtig for korrekt snoRNA-syntese og nukleolær lokalisering. H/ACA box snoRNA har en sekundær struktur, der består af to hårnåle og to enkeltstrengede regioner. Dette er almindeligvis kendt som hårnåle-hængsel-hårnåle-hale-strukturen. H/ACA box snoRNA består også af to bevarede motiver H og ACA. Begge er placeret i enkeltstrengede regioner. H-boksen er i hængslet, og ACA er i haleregionen. Tre nukleotider danner 3'-enden af sekvensen.
Hvad er lighederne mellem snRNA og snoRNA?
- snRNA og snoRNA er små RNA'er.
- Begge er til stede i eukaryote celler.
- Begge er ikke-kodende RNA-molekyler.
- Desuden deltager de i at modificere RNA under transkriptionsprocessen.
Hvad er forskellen mellem snRNA og snoRNA?
snRNA deltager i alternativ splejsning af præ-mRNA, mens snoRNA hovedsageligt modificerer RNA-molekyler. Dette er således den vigtigste forskel mellem snRNA og snoRNA. Desuden er snRNA'er omkring 150 nukleotider lange og findes ofte forbundet med en gruppe af proteiner og komplekser kaldet små nukleare ribonukleoproteiner. snoRNA'er er omkring 60-170 nukleotider lange og findes hovedsageligt i nukleolus.
Desuden transskriberes snRNA'er af enten RNA-polymerase II eller RNA-polymerase III, hvorimod snoRNA kun transskriberes af RNA-polymerase II.
Nedenstående infografik præsenterer forskellene mellem snRNA og snoRNA i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – snRNA vs snoRNA
snRNA og snoRNA er klasser af små RNA-molekyler. snRNA deltager i alternativ splejsning af præ-mRNA, mens snoRNA hovedsageligt modificerer RNA-molekyler. Dette er således den vigtigste forskel mellem snRNA og snoRNA. Små RNA er polymere RNA-molekyler, der består af mindre end 200 nukleotider i længden og er norm alt ikke-kodende. snRNA'er findes i kernen af eukaryoter. snoRNA'er findes i archaea og eukaryoter. Transskription af snRNA foregår gennem RNA polymerase II og II, mens kun RNA polymerase II er involveret i transskribering af snoRNA. Så dette opsummerer forskellen mellem snRNA og snoRNA.
