Nøgleforskellen mellem aminoacyl-tRNA og peptidyl-tRNA er, at aminoacyl-tRNA er et tRNA-molekyle, der er bundet til A-stedet i ribosomet, mens peptidyl-tRNA er et tRNA-molekyle, der er bundet til P-stedet i ribosomet.
Transfer RNA (tRNA) er et RNA-molekyle, der hjælper med at afkode en messenger-RNA (mRNA)-sekvens til et protein. Ved proteinsyntese danner tRNA-molekylet basepar med dets komplementære sekvens på mRNA'et (budbringer-RNA). Dette sikrer, at den passende aminosyre indsættes i den voksende polypeptidkæde (proteinmolekyle). Derfor er tRNA en væsentlig komponent til translationstrinnet i proteinsyntese. Aminoacyl-tRNA og peptidyl-tRNA er to typer tRNA-molekyler, der deltager i translationstrinnet i proteinsyntesen.
Hvad er Aminoacyl-tRNA?
Aminoacyl-tRNA er et tRNA-molekyle, der bærer en enkelt aminosyre ved terminus. Det binder norm alt til det tilstødende A-sted i ribosomet. Aminoacyl-tRNA'et, sammen med særlige forlængelsesfaktorer, leverer den specifikke aminosyre til ribosomet til inkorporering i polypeptidkæden under translation. Hver aminosyre har sit eget specifikke aminoacyl-tRNA-syntetaseenzym. Dette enzym udnyttes af aminosyrer til kemisk at binde til det specifikke tRNA. Bindingen af et tRNA med dets beslægtede aminosyre er afgørende. Dette sikrer, at kun den specifikke aminosyre, der matcher anticodonet af tRNA, bruges under proteinsyntesen. For at forhindre translationsfejl har aminoacyl tRNA-syntetase-enzymet korrekturlæsning. De aminosyrer, der er misacyleret med det rigtige tRNA-molekyle, gennemgår norm alt hydrolyse. Dette udføres af deacyleringsmekanismen af aminoacyl-tRNA-syntetase-enzymet. Desuden bør det fejlopladede tRNA hydrolyseres for at forhindre forkert proteinsyntese.
Figur 01: Aminoacyl-tRNA
Ud over funktionen i proteinsyntese kan aminoacyl-tRNA også fungere som donor af aminosyrer, der er nødvendige for modifikation af lipider og biosyntese af antibiotika. Desuden er det også underforstået, at genklynger kan anvende aminoacyl-tRNA til at regulere syntesen af kodede polypeptider.
Hvad er Peptidyl-tRNA?
Peptidyl-tRNA er et tRNA-molekyle, der er bundet til P-stedet i ribosomet. Efter at initieringskomplekset er dannet korrekt, forløber translationen ved forlængelse af polypeptidet. Ribosomet har tre steder for tRNA-binding: P (peptidyl), A (aminoacyl) og E (eksisterer).
Figur 02: Peptidyl-tRNA
Initiatoren methionyl-tRNA er altid bundet til P-stedet. Det næste aminoacyl-tRNA binder til A-stedet ved hjælp af en forlængelsesfaktor (EF-Tu i prokaryoter og eEf-1α i eukaryoter) og GTP. Efter binding frigives GDP (hydrolyseret GTP) molekylet. Senere dannes en peptidbinding mellem methionyl-tRNA på P-stedet og det andet aminoacyl-tRNA på A-stedet. Denne reaktion katalyseres af peptidyltransferase-enzymet. Denne reaktion overfører methionin til aminoacyl-tRNA'et på A-stedet og danner således et peptidyl-tRNA. Desuden bevæger peptidyl-tRNA sig under translokationsstadiet til P-stedet af ribosomet ved hjælp af forlængelsesfaktorer (EFG i prokaryoter og eEf-2 i eukaryoter) og GTP-hydrolyse. Derudover flytter det uladede tRNA først til E-stedet i ribosomet og forlader derefter E-stedet ved afslutningen af processen.
Hvad er lighederne mellem Aminoacyl-tRNA og Peptidyl-tRNA?
- Aminoacyl-tRNA og peptidyl-tRNA er to typer tRNA-molekyler, der deltager i translation.
- Begge er tRNA-molekyler, der består af ribonukleotidbaser: adenin, cytosin, guanin og uracil.
- Aminosyrer er forbundet med begge molekyler.
- De spiller en afgørende rolle i proteinsyntesen.
- Begge deltager i forlængelsestrinnet i oversættelsen.
Hvad er forskellen mellem Aminoacyl-tRNA og Peptidyl-tRNA?
Aminoacyl tRNA er et tRNA-molekyle, der er bundet til A-stedet i ribosomet, mens peptidyl-tRNA er et tRNA-molekyle, der er bundet til P-stedet i ribosomet. Så dette er den vigtigste forskel mellem aminoacyl tRNA og peptidyl tRNA. Endvidere bærer aminoacyl tRNA en enkelt aminosyre ved terminus, mens peptidyl tRNA bærer en peptidkæde ved terminus.
Nedenstående infografik viser forskellene mellem aminoacyl-tRNA og peptidyl-tRNA i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Aminoacyl tRNA vs Peptidyl tRNA
tRNA er et molekyle, der hjælper med at afkode en mRNA-sekvens til et protein. Aminoacyl tRNA og peptidyl tRNA er to typer tRNA-molekyler, der deltager i translationsprocessen. Aminoacyl tRNA er bundet til A-stedet af ribosomet under translationsprocessen, mens peptidyl tRNA er bundet til P-stedet af ribosomet under translationsprocessen. Dette opsummerer således forskellen mellem aminoacyl-tRNA og peptidyl-tRNA.
