Nøgleforskellen mellem restriktionsendonuklease og exonuklease er, at restriktionsendonuklease er et nukleaseenzym, der genkender en specifik DNA-sekvens og sp alter DNA'et i eller ved siden af denne sekvens, mens exonuklease er et nukleaseenzym, der sp alter nukleotiderne i en polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden én ad gangen.
Nukleaser er de enzymer, der sp alter phosphodiesterbindinger mellem nukleotider af nukleinsyrer. I levende organismer er de essentielle værktøjer til mange aspekter af DNA-reparation i cellen. Defekter af disse enzymer kan forårsage genetisk ustabilitet og immundefekt. Restriktionsnukleaserne er specifikke nukleaser, hvis funktion er afhængig af en specifik nukleotidsekvens. Et eksempel er restriktionsendonuklease. Der er en grundlæggende klassificering for nukleaser baseret på aktivitetsstedet, såsom endonuklease og exonuklease. Endonuklease fordøjer områder i midten af mål-DNA-molekylet. Exonuclease fordøjer nukleinsyrer fra enderne. Derfor er restriktionsendonuklease og exonuklease to typer nukleaseenzymer.
Hvad er restriktionsendonuklease?
Restriktionsendonuklease er et nukleaseenzym, der genkender en specifik DNA-sekvens og sp alter DNA'et i eller ved siden af denne sekvens. Den specifikke DNA-sekvens er kendt som restriktionsstedet. Det kaldes også et restriktionsenzym eller restriktase. Restriktionsendonukleasen er et meget specifikt enzym. Det er en klasse af den bredere endonukleasegruppe af enzymer. Restriktionsendonukleaser er almindeligvis klassificeret i fem typer, som adskiller sig i deres struktur og evne til at skære DNA-substratet på genkendelsesstedet. De fem typer er type I, type II, type III, type IV og type V.
Figur 01: Restriktionsendonuklease
Restriktionsendonukleaser findes norm alt i bakterier og archaea. De giver en forsvarsmekanisme for bakterier mod vira. Der er mere end 3600 kendte restriktionsendonukleaser. De repræsenterer over 250 forskellige specificiteter. Over 3000 af disse er blevet undersøgt i detaljer. Desuden er mere end 800 af disse tilgængelige kommercielt.
Hvad er Exonuclease?
Exonuclease er et nukleaseenzym, der sp alter nukleotiderne i et polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden én ad gangen. Dette sker gennem en hydrolysereaktion, der bryder phosphodiesterbindinger mellem nukleotiderne i slutningen. Eukaryoter og prokaryoter har tre typer exonukleaser. Disse exonukleaser er involveret i den normale omsætning af mRNA. De er 5' til 3' exonuclease (Xrn1), 3' til 5' exonuclease og poly-A-specifik 3' til 5' exonuclease. 5' til 3' exonuklease er et afhængigt afdækningsprotein. 3' til 5' exonuklease er et uafhængigt protein. Poly A specifik 3' til 5' exonuklease er også kendt som poly-A specifik ribonuklease involveret i exonukleolytisk nedbrydning af poly-A hale.
Figur 02: Exonuclease
I både archaea og eukaryoter udføres RNA-nedbrydning af multi-protein exosomkomplekset, der består af 3' til 5' exoribonukleaser.
Hvad er lighederne mellem restriktionsendonuklease og exonuklease?
- Restriktionsendonuklease og exonuklease er to typer nukleaseenzymer.
- Begge enzymer skærer DNA-molekyler.
- Disse enzymer findes i prokaryoter.
- De er proteiner.
Hvad er forskellen mellem restriktionsendonuklease og exonuklease?
Restriktionsendonuklease er et nukleaseenzym, der genkender en specifik DNA-sekvens og sp alter DNA'et i eller ved siden af denne sekvens, mens exonuklease er et nukleaseenzym, der sp alter nukleotiderne i et polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden en ad gangen. Så dette er den vigtigste forskel mellem restriktionsendonuclease og exonuclease. Desuden findes restriktionsendonuklease kun i prokaryoter, mens exonuklease findes i både prokaryoter og eukaryoter.
Den følgende infografik viser forskellene mellem restriktionsendonuklease og exonuklease i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – begrænsning af endonuklease vs. exonuklease
Nukleaser er de enzymer, der bryder phosphodiesterbindinger mellem nukleotider af nukleinsyrer. Restriktionsendonuklease og exonuklease er to typer nukleaseenzymer. Restriktionsendonuklease er et nukleaseenzym, der genkender en specifik DNA-sekvens og sp alter DNA'et i eller ved siden af denne sekvens. Exonuclease er et nukleaseenzym, der sp alter nukleotiderne i et polynukleotid fra enten deres 5'-ende eller 3'-ende én ad gangen. Dette opsummerer således forskellen mellem restriktionsendonuklease og exonuklease.
