Nøgleforskellen mellem cis- og trans-splejsning er, at cis-splejsning er en intramolekylær mekanisme, der fjerner introner og forbinder de exoner, der er inden for det samme RNA-transkript, mens trans-splejsning er en intermolekylær mekanisme, der fjerner introner eller outroner og forbinder de exoner, der ikke er inden for det samme RNA-transkript.
RNA-splejsning er en form for RNA-behandling før proteinsyntese. I denne proces transformeres et nyfremstillet præ-messenger-RNA-transkript til et modent messenger-RNA. Modent messenger-RNA hjælper med at producere et proteinmolekyle. Under RNA-splejsning fjernes intronerne (ikke-kodende regioner), og exoner (kodende regioner) samles for at danne modent mRNA. Cis- og transsplejsning er to typer RNA-splejsningsmekanismer.
Hvad er Cis-splejsning?
Cis-splejsning er en intramolekylær mekanisme, der fjerner introner og forbinder de exoner, der er inden for det samme RNA-transkript. Normal cis-splejsning behandler et enkelt RNA-molekyle. Cis-splejsning er den typiske splejsningsproces af præ-mRNA udført af splejsosomer. I intronen er et donorsted (5'-enden af intronen), et forgreningssted (nær 3'-enden af intronen) og et acceptorsted (3'-enden af intronen) yderst essentielle for splejsning. Splejsningsdonorstedet inkluderer en invariant sekvens GU ved 5'-enden af intronen. Splejsningsacceptorstedet ved 3'-enden af intronen har en invariant AG-sekvens. Opstrøms fra AG-sekvensen er der en region kaldet pyrimidinregionen (polypyrimidinkanalen). Længere opstrøms fra polypyrimidinkanalen er der et forgreningspunkt, der inkluderer et adenosin-nukleotid. Dette nukleotid er involveret i lariatdannelse.
Figur 01: Cis- og transsplejsning
De vigtigste splejsosomer er U1, U2, U4, U5 og U6. Blandt dem er U1 og U2 meget vigtige. Ved cis-splejsning binder U1 til 5'-splejsningsstedet, og U2 binder til forgreningspunktet nær 3'-splejsningsstedet. U5/U4/U6 binder exoner på 5'-stedet, med U6-binding til U2. Senere udkommer U1. U5 skifter fra exon til intron, og U6 binder på 5' splejsningsstedet. Ydermere er U4 også udgivet. U6/U2 katalyserer transesterificering, hvilket får 5'-enden af intronen til at ligere til A-nukleotidet på intron. Dette udløser lariatdannelse. Ved dannelsen af et lariat binder U5 exon på 3'-splejsningsstedet, og 5'-stedet sp altes. Ved den sidste fase af splejsningen forbliver U2/U5/U6 bundet til lariatet, og 3'-stedet sp altes. Ud over det ligeres exonerne ved hjælp af ATP-hydrolyse i denne fase.
Hvad er transsplejsning?
Trans-splejsning er en intermolekylær mekanisme, der fjerner introner eller outroner og forbinder de exoner, der ikke er inden for det samme RNA-transkript. Ved trans-splejsning er der ikke noget 5'-splejsningssted på præ-mRNA-molekylet for U1-protein at binde. I stedet transsplejses SL-RNA (capped splejsningsleder) til sekvens i outronen.
Figur 02: Transsplejsning
Outron er en region af præ-mRNA'et mellem 5'-hætten og trans-splejsningsstedet. Imidlertid binder U2-protein norm alt til 3'-splejsningsstedet. Efter fjernelse af outron splejses splejsningsleder-exonet (SL) til det første exon på præ-mRNA'et. Desuden er transsplejsning en mekanisme, der observeres i visse mikroorganismer, såsom protister af Kinetoplastae-klassen, for at udtrykke gener.
Hvad er lighederne mellem Cis- og Trans-splejsning?
- Cis- og transsplejsning er to typer RNA-splejsningsmekanismer.
- I begge mekanismer fjernes introner.
- I begge mekanismer er exoner også forbundet for at danne modent mRNA.
- Begge mekanismer findes i eukaryoter.
- Disse mekanismer er fraværende i prokaryoter.
Hvad er forskellen mellem Cis- og Trans-splejsning?
Cis-splejsning er en intramolekylær mekanisme, der fjerner introner og forbinder de exoner, der er inden for det samme RNA-transkript, mens trans-splejsning er en intermolekylær mekanisme, der fjerner introner eller outroner og forbinder de exoner, der ikke er inden for det samme RNA afskrift. Så dette er den vigtigste forskel mellem cis- og trans-splejsning. Endvidere fjernes introner ved cis-splejsning for at danne modent mRNA. På den anden side fjernes introner eller outroner ved trans-splejsning for at danne modent mRNA.
Den følgende infografik viser forskellene mellem cis- og trans-splejsning i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – Cis vs Trans Splicing
RNA-splejsning er en form for RNA-behandling før proteinsynteseprocessen. Cis- og trans-splejsning er to typer RNA-splejsningsmekanismer, der findes i eukaryoter. Cis-splejsning er en intramolekylær mekanisme, der fjerner introner og forbinder de exoner, der er inden for det samme RNA-transkript, mens trans-splejsning er en intermolekylær mekanisme, der fjerner introner eller outroner og forbinder de exoner, der ikke er inden for samme RNA-transkript. Dermed afslutter dette diskussionen om forskellen mellem cis- og transsplejsning.
