Nøgleforskellen mellem gruppe I- og gruppe II-introner er, at i gruppe I-introner initieres splejsningsreaktionen af en guanosin-cofaktor, mens splejsningsreaktionen i gruppe II-introner initieres af intern adenosin.
Pre-mRNA er det primære transkript, der har både introner og exoner. Præ-mRNA bør omdannes til mRNA før translation. RNA-splejsning eller præ-mRNA-splejsning er en sådan post-transkriptionel modifikation. Ved RNA-splejsning fjernes introner fra præ-mRNA-molekylet, og exoner forbindes. Gruppe I- og gruppe II-introner er selvsplejsende introner. De splejser fra præ-mRNA-molekyle uden hjælp fra noget andet enzym. Derfor er de RNA-enzymer eller ribozymer, der katalyserer deres egen splejsning fra præ-mRNA. Desuden har de evnen til at fungere som mobile elementer. Under splejsningen finder en række transesterificeringsreaktioner sted for at udskære intronen og ligere exonerne. Disse ribozymer er til stede i alle tre domæner, inklusive bakterier, archaea og eukaryoter.
Hvad er gruppe I-introner?
Gruppe I-introner er en type selvsplejsende ribozymer, der findes i bakterier, bakteriofager og eukaryoter (organelle og nukleare genomer). De findes i essentielle gener. De er i stand til at katalysere deres egen splejsning fra præ-mRNA-molekylet. Gruppe I-introner kan have et par hundrede til tre tusinde nukleotider. Desuden udviser de ringe sekvenslighed på tværs af organismer.
Figur 01: Gruppe I Introns
De sekundære strukturer er meget bevarede i fire korte områder. Der er to transesterificeringsreaktionstrin til splejsning. Gruppe I-introner initierer splejsningsmekanisme ved det nukleofile angreb af 3'-hydroxylen af en guanosin-cofaktor ved 5P-splejsningsstedet.
Hvad er gruppe II-introner?
Gruppe II-introner er en type selvsplejsende introner, der findes i organismer, der tilhører alle tre domæner. De er ribozymer, der katalyserer deres egne splejsningsreaktioner fra præ-mRNA. De findes i rRNA, tRNA og proteinkodende gener. Men de findes ikke i nukleare genomer, i modsætning til gruppe I-introner.
Figur 02: Group II Introns
Gruppe II-introner katalyserer splejsning via to transesterificeringstrin svarende til gruppe I-introner. Disse enzymer initierer splejsningsreaktionen ved det nukleofile angreb af 2′ OH af grenstedet adenosin på 5′ splejsningsforbindelsen. Under splejsningsreaktioner danner gruppe II-introner en lariatlignende struktur. Desuden finder intronsplejsning sted i fravær af GTP.
Hvad er lighederne mellem gruppe I- og gruppe II-introner?
- Gruppe I- og gruppe II-introner er to typer RNA-enzymer, ribozymer, der katalyserer deres egen splejsning ved forskellige mekanismer.
- De er store ribozymer.
- Begge findes i alle tre domæner.
- De er mobile elementer.
- De findes desuden i rRNA, tRNA og proteinkodende gener.
- Begge enzymer bruger som værktøjer inden for bioteknologi og molekylær medicin til målrettet gen-knock-out/knock-down, genlevering eller genterapisystemer.
Hvad er forskellen mellem gruppe I- og gruppe II-introner?
Gruppe I-introner er ribozymer, der findes i bakterier, bakteriofager og eukaryote organelle og nukleare genomer. Gruppe II-introner er ribozymer, der findes i bakterier, archaea og eukaryote organeller. Desuden initierer gruppe I-intronerne splejsningsreaktion ved det nukleofile angreb af 3'-hydroxyl af en guanosin-cofaktor ved 5P-splejsningsstedet, mens gruppe II-introner initierer splejsningsreaktion ved det nukleofile angreb af 2'OH-delen af grenstedets adenosin på 5′ splejsningsforbindelse. Så dette er den vigtigste forskel mellem gruppe I- og gruppe II-introner.
Yderligere danner gruppe II-introner en lariat-lignende struktur under splejsningen, mens gruppe I-introner ikke dannes. Dette er således en anden signifikant forskel mellem gruppe I og gruppe II introner. Desuden findes gruppe I-intronerne i eukaryote nukleare genomer, mens gruppe II-introner ikke findes i eukaryote nukleare genomer.
Infografikken nedenfor viser forskellene mellem gruppe I- og gruppe II-introner i tabelform til sammenligning side om side.
Oversigt – Gruppe I vs Gruppe II Introns
Gruppe I- og II-introner er store ribozymer, der katalyserer en transesterificeringsreaktion for at splejse introner fra det primære transkript. De findes i alle tre domæner. De er begge mobile genetiske elementer. Desuden bruges de som værktøjer inden for bioteknologi og molekylær medicin. Imidlertid initierer gruppe I-intronerne splejsningsreaktion ved det nukleofile angreb af 3' OH af en guanosin-cofaktor ved 5P-splejsningsstedet. Men gruppe II-intronerne initierer splejsningsreaktion ved det nukleofile angreb af 2′ OH af grenstedet adenosin på 5′ splejsningsforbindelsen. Desuden danner gruppe II-introner en lariatlignende struktur under splejsningen, mens gruppe I-introner ikke danner en lariatlignende struktur. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem gruppe I- og gruppe II-introner.
