Nøgleforskellen mellem ORF og exon er, at ORF eller den åbne læseramme er en strækning af DNA-sekvens, der begynder med translationsinitieringssted (startkodon) og slutter med translationstermineringssted (stopkodon), mens exon er en nukleotidsekvens i et gen, der koder for aminosyrer.
En åben læseramme er en del af en læseramme. Læserammer læses af ribosomer for at lave proteiner. ORF er en kontinuerlig strækning af kodoner, som giver et fuldt funktionelt protein. Det begynder med et startkodon og ender med et stopkodon. Inde i ORF'en er der ingen stopkodon, der afbryder den kodende sekvens. Translation starter ved startkodon og slutter ved stopkodon. Exon er en nukleotidsekvens af et gen. Det koder for proteinets aminosyrer. Derfor er exoner kodende regioner af et gen.
Hvad er en ORF?
Åben læseramme eller ORF er den kontinuerlige strækning af en nukleotidsekvens, der begynder med et startkodon og slutter med et stopkodon. Med enkle ord refererer ORF til regionen af nukleotidsekvensen placeret mellem start- og stopkodonerne. Ind imellem er der ingen stopkodon, der afbryder ORF. Nukleotidsekvensen mellem start- og stopkodon koder for aminosyrer. Generelt er startkodon ATG, mens stopkodoner er TAG, TAA og TGA. ORF giver et funktionelt protein, når det transskriberes og translateres. Derfor omfatter ORF et startkodon, flere kodoner i midterregionen og et stopkodon. Interessant nok har ORF en længde, der kan divideres med tre.
Figur 01: ORF
I prokaryoter, da der ikke er nogen introner, er ORF den kodende region af et gen, som transskriberer direkte til mRNA. I eukaryoter, da der er introner, er ORF kodonsekvensen, der resulterer efter behandling eller RNA-splejsning. ORF er et stykke bevis, der hjælper genforudsigelse, da lange ORF'er sandsynligvis er en del af et gen.
Hvad er en Exon?
Exoner er de kodende nukleotidsekvenser af gener, der oversættes til proteiner. De er på hver side af en intron. Efter fjernelse af ikke-kodende sekvenser fra præ-mRNA'et består det modne mRNA-molekyle kun af exonsekvenser. Derefter konverteres nukleotidsekvensen af det endelige RNA-molekyle (modent mRNA) til en aminosyresekvens af et specifikt protein.
Figur 02: Exons
Næsten alle gener har en indledende nukleotidsekvens, der adskiller det som et gen fra hoved-DNA- eller RNA-strengen, som er kendt som Open Reading Frame (ORF. I nogle gener markerer to ORF'er hele genet og exonerne er placeret i den kodende sekvens. Selvom det lyder, at exoner altid udtrykkes i gener, er der tilfælde, hvor intronsekvenser intervenerer med exonet og forårsager mutationer, og denne proces er kendt som eksonisering.
Hvad er lighederne mellem ORF og Exon?
- Både ORF og exon er nukleotidsekvenser.
- Lang ORF og exoner er dele af et gen.
- Begge har kodningssekvenser.
Hvad er forskellen mellem ORF og Exon?
ORF og exon er nukleotidsekvenser. ORF refererer til enhver strækning af DNA-sekvens placeret mellem et startkodon og et stopkodon. I modsætning hertil er exonet en kodende nukleotidsekvens af et gen, der koder for aminosyrer. Dette er således den vigtigste forskel mellem ORF og exon. Exoner er dele af et gen, mens lang ORF sandsynligvis er en del af et gen. Desuden er der introner på begge sider af en exon, mens ORF ikke inkluderer introner.
Nedenstående infografik opsummerer forskellen mellem ORF og exon i tabelform.
Oversigt – ORF vs Exon
Den åbne læseramme (ORF) er en del af læserammen. Det er den kontinuerlige strækning af DNA-sekvensen, der begynder med et startkodon og ender med et stopkodon. Exon er en nukleotidsekvens af et gen. Det koder for en del af mRNA-sekvensen. Derfor er exoner dele af gensekvensen, der udtrykkes i proteinet. Dette opsummerer således forskellen mellem ORF og exon.
