Nøgleforskellen mellem PARP1 og PARP2 er, at plante- og dyre-PARP1 bærer Zn-finger DNA-bindingsmotiver, mens plante PARP2 bærer N-terminale SAP DNA-bindingsmotiver.
Poly ADP-ribosepolymerase (PARP) er en familie af proteiner, der er nukleare enzymer. Der er 17 forskellige typer PARP-enzymer i PARP-familien. PARP1 og PARP2 er to enzymer, der er essentielle for normale DNA-reparationsaktiviteter.
Hvad er PARP?
PARP (Poly ADP-ribosepolymerase) er en familie af proteiner, der tjener i adskillige cellulære processer som DNA-reparation, genomisk stabilitet og programmeret celledød. De katalyserer en proces kaldet ADP-ribosylering. ADP-ribosylering refererer til tilføjelsen af ADP-ribose-enheder fra nikotinamid-adenindinukleotid (NAD) til målsubstrater for at reparere DNA-strengbrud.
PARP-enzymer er DNA-bindende proteiner. De aktiveres af hakkene i DNA-molekyler. Når de først binder med DNA-brud, hydrolyserer de NAD+ til nikotinamid og fremmer polymerisationen af ADP-ribosen. Derfor deltager PARP nukleare enzymer i DNA-reparation. Desuden fungerer poly-ADP-ribosylering som en post-translationel modifikation, der spiller en nøglerolle i replikation, transkriptionel regulering, telomervedligeholdelse og proteinnedbrydning. PARP-enzymer deltager også i opretholdelsen af genomets stabilitet, regulering af kromatinstruktur, celleproliferation og apoptose.
Hvad er PARP1?
PARP1 er medlem af PARP-proteinfamilien. Det er det første og bedst karakteriserede protein i denne familie. Det fungerer som en første responder, der registrerer DNA-skader og derefter letter valget af reparationsmekanisme. Desuden regulerer PARP1 reparationen af enkeltstrengede DNA-skader.
Figur 01: PARP1
Ud over at reparere enkeltstrengede DNA-brud, regulerer PARP1 replikationsgaffelprogression og genstart. Ydermere fremmer den alternative ikke-homologe endesammenføjninger.
Hvad er PARP2?
PARP2 er et andet medlemsprotein i PARP-proteinfamilien. Det er tæt beslægtet med PARP1-enzym. Genet PARP2 koder for PARP2-protein hos mennesker. PARP2 har et katalytisk domæne, men mangler N-termin alt DNA-bindingsdomæne. PARP-hæmmere anti-cancer-lægemidler kan hæmme PARP2, svarende til PARP1.
Figur 02: PARP2
I planter, især i Arabidopsis thaliana, spiller PARP2 en væsentlig rolle i beskyttende reaktioner på DNA-skader og bakteriel patogenese end PARP1.
Hvad er lighederne mellem PARP1 og PARP2?
- PARP1 og PARP2 er to typer nukleare enzymer.
- De bruger NAD+ som deres substrat til at katalysere poly ADP-ribosylering.
- Begge aktiveres af DNA-enkeltstrengsbrud.
- Pattedyr PARP1 og PARP2 er placeret i kernen.
- Både PARP1 og PARP2 interagerer med kromatin.
- De reparerer DNA-skader.
- Nogle PARP-hæmmere anti-cancer-lægemidler rettet mod PARP1 hæmmer også PARP2.
Hvad er forskellen mellem PARP1 og PARP2?
PARP1 er et medlem af PARP-proteinfamilien, som har et katalytisk domæne og N-termin alt DNA-bindingsdomæne, mens PARP2 er et medlem af PARP-familien, som mangler N-termin alt DNA-bindingsdomæne. Den vigtigste forskel mellem PARP1 og PARP2 er, at plante- og dyre-PARP1 bærer Zn-finger DNA-bindingsmotiver, mens plante PARP2 bærer N-terminale SAP DNA-bindingsmotiver.
Den følgende infografik opsummerer forskellen mellem PARP1 og PARP2.
Oversigt – PARP1 mod PARP2
PARP'er er nukleare enzymer, der registrerer DNA-skader og reparerer dem. PARP1 og PARP2 er to af dem, der er tæt beslægtede. Begge enzymer har et katalytisk domæne. Men PARP2 mangler N-termin alt DNA-bindende domæne, som er til stede i PARP1. Dette er således den vigtigste forskel mellem PARP1 og PARP2. Begge typer enzymer bruger NAD+ som deres substrat.