Nøgleforskellen mellem CDS og cDNA er, at CDS eller kodende sekvens er den del af et transkript, der faktisk er oversat til protein, mens cDNA-sekvensen er en DNA-sekvens afledt af mRNA'et ved omvendt transkription.
Et gen er en nukleotidsekvens, som koder for et protein. Den består af forskellige regioner som promotorregion, transkriptionsinitieringssted, exoner, startkodon, introner og stopkodon. Derfor har et gen både kodende og ikke-kodende sekvenser. Kodende sekvenser eller CDS refererer til exonerne og to kodoner, som er startkodon og stopkodon. Det er sekvensen, der faktisk oversættes til et protein. I modsætning hertil er cDNA en DNA-sekvens afledt af mRNA'et ved omvendt transkription.
Hvad er CDS?
CDS eller kodende sekvens er en del af et gen, som faktisk er oversat til et protein. Den består af exoner og to kodoner som AUG-kodon og stopkodon. I modsætning til cDNA indeholder CDS ikke to uoversatte regioner: 5' UTR og 3' UTR. Desuden er introner ikke inkluderet i CDS.
Figur 01: Kodningssekvens
Sammenlignet med hele genomet og et individ er kodende sekvenser en lille del. Kodningssekvensen består af den nødvendige nukleotidsekvens for at danne proteinets aminosyresekvens.
Hvad er cDNA?
cDNA eller komplementært DNA er en DNA-sekvens genereret ud fra mRNA-sekvens. Det syntetiseres ved den proces, der kaldes omvendt transkription. Enzymet revers transkriptase katalyserer cDNA-syntese, og mRNA-sekvensen fungerer som skabelon for cDNA-syntese. Dybest set kan mRNA fra eukaryote celler ekstraheres og oprenses for at lave cDNA. Efter konstruktion af cDNA fra mRNA kan de derefter klones ind i en bakteriecelle for at lave cDNA-biblioteker. cDNA-biblioteker er vigtige for analysen af kodende regioner, genfunktioner og ekspression af gener osv.
Figur 02: cDNA
I modsætning til kodende sekvens indeholder cDNA to UTR'er, som er 3' UTR og 5' UTR. I lighed med den kodende sekvens indeholder cDNA ikke introner.
Hvad er lighederne mellem CDS og cDNA?
- CDS og cDNA er nukleinsyrer.
- De er lavet af deoxyribonukleotider.
- Både CDS og CDNA indeholder ikke introner, som er ikke-kodende områder.
- Begge indeholder den genetiske kode eller information til at producere et protein.
Hvad er forskellen mellem CDS og cDNA?
CDS eller kodende sekvens er den del af et gen, der faktisk er oversat til et protein. På den anden side er cDNA-sekvens en DNA-sekvens afledt af mRNA'et ved omvendt transkription. Så dette er den vigtigste forskel mellem CDS og cDNA. Desuden består CDS af exoner og to kodoner, som er startkodon og stopkodon. I modsætning hertil består cDNA af den komplette mRNA-sekvens og to UTR'er.
Desuden udføres cDNA-syntese kunstigt fra mRNA ved omvendt transkription, mens CDS findes i det genomiske DNA.
Infografikken nedenfor viser flere sammenligninger for at skelne mellem CDS og cDNA.
Oversigt – CDS vs cDNA
Kodende sekvens og cDNA er to typer nukleotidsekvenser. Kodende sekvens ligger i et gen, mens cDNA syntetiseres kunstigt. Kodende sekvens har exoner og to kodoner, mens cDNA har en mRNA-sekvens og to UTR'er. Både CDS og cDNA har kun de nukleotidsekvenser, som faktisk oversættes til et protein. De indeholder ikke introner. I modsætning til CDS kræver cDNA-synteseprocessen revers transkriptase-enzym. Også cDNA kan konvertere til cDNA-biblioteker. Dette opsummerer således forskellen mellem CDS og cDNA.
