Nøgleforskellen mellem kandidatgenet og GWAS er, at kandidatgentilgangen undersøger den genetiske variation inden for et lille antal forudspecificerede gener af interesse, mens GWAS undersøger hele genomet for en fælles genetisk variation bag en bestemt sygdomstilstand.
Kandidatgentilgang og genom-dækkende associationsstudier (GWAS) er to metoder, der er vigtige for at påvise genetisk modtagelighed for sygdomme. Kandidatgentilgang er baseret på et forudbestemt lille antal gener, mens GWAS er baseret på test af hele genomet. Derfor kræver kandidatgentilgang forudgående viden om gener med relevans for sygdommen, i modsætning til GWAS.
Hvad er kandidatgenet?
Kandidatgentilgang er en af de teknikker, der undersøger sammenhængen mellem genetisk variation inden for forudspecificerede gener af interesse og fænotyper eller sygdomstilstande. I denne tilgang er det nødvendigt at have forudgående viden om genets biologiske funktionelle påvirkning af den pågældende egenskab eller sygdom. Baseret på denne viden udvælges et lille antal gener og analyseres for genetisk variation.
Figur 01: Kandidatgentilgang
Udvælgelse af generne er baseret på den biologiske, fysiologiske og funktionelle relevans for den pågældende sygdom i denne tilgang. Denne tilgang er ofte designet som en case-kontrolundersøgelse.
Hvad er GWAS?
GWAS står for Genome-Wide Association Study. Det refererer også til hel-genomforeningsstudier. Disse undersøgelser fokuserer hovedsageligt på observationsstudier. De analyserer de genetiske varianter af forskellige individer, der norm alt er forbundet med et specifikt træk. Hele genomet er vigtigt for GWAS-analyse.
GWAS er et vigtigt værktøj i analysen af enkeltnukleotidpolymorfismer forbundet med forskellige sygdomstilstande. Det er en sammenlignende undersøgelse af de forskellige enkeltnukleotidpolymorfismer på tværs af en bred population. Undersøgelsesprøven af GWAS er meget høj; derfor tager det også formatet af en tværsnits kohorteundersøgelse.
Figur 02: GWAS
Den første GWAS-undersøgelse fandt sted med hensyn til myokardieinfarkt og analyse af generne forbundet med myokardieinfarkt. På nuværende tidspunkt spiller GWAS en vigtig rolle i at bestemme den genetiske baggrund for komplekse sygdomme med ukendt ætiologi.
Hvad er lighederne mellem kandidatgenet og GWAS?
- Både kandidatgentilgangen og GWAS er teknikker, der analyserer den genetiske sammenhæng mellem sygdommens genotype og fænotype.
- Begge tilgange hjælper med at forstå det genetiske grundlag for modtagelighed over for sygdom.
Hvad er forskellen mellem kandidatgen og GWAS?
Kandidatgentilgangen er baseret på kandidatgenerne eller præspecificerede gener, mens GWAS er baseret på hele genomet. Så dette er den vigtigste forskel mellem kandidatgen og GWAS. I kandidatgentilgangen er udvælgelsen af gener også nødvendig, mens det ikke er nødvendigt i GWAS.
Derudover kræver en kandidatgentilgang forudgående viden om de gener, der er relevante for sygdommen, mens det ikke er nødvendigt for GWAS.
Infografikken nedenfor giver en mere detaljeret sammenligning relateret til forskellen mellem kandidatgenet og GWAS.
Opsummering – kandidatgen vs GWAS
Kandidatgen og GWAS er to genassocieringsundersøgelser. Kandidatgentilgang fokuserer på den genetiske variation forbundet med sygdommen inden for et lille antal præspecificerede gener. I modsætning hertil undersøger GWAS den genetiske variation forbundet med sygdommen inden for hele genomet. Så dette er den vigtigste forskel mellem kandidatgen og GWAS. Begge metoder er vigtige for at forstå det genetiske grundlag for modtagelighed over for sygdom.
