Nøgleforskellen mellem genkortlægning og gensekventering er, at genkortlægning er en teknik, der identificerer placeringen af et gen i genomet og afstandene mellem gener, mens gensekventering er en teknik, der identificerer den præcise rækkefølge af nukleotider af et gen.
Genkortlægning og gensekventering er vigtige i genetisk diagnostik for at lokalisere og bekræfte tilstedeværelsen af gener. Således spiller molekylære teknikker såsom gelelektroforese og polymerasekædereaktion vigtige roller i at udlede et genkort. Desuden er brugen af forskellige sekventeringsteknikker såsom Sanger-sekventering og Next-Generation-sekventering afgørende for at generere en gensekvens.
Hvad er genkortlægning?
Genkortlægning er teknikken til at generere et komplet kort over placeringen af gener i et kromosom. Kromosomkortlægning er et synonym for genkortlægning. Yderligere giver denne teknik information om de specifikke gener, der er placeret i kromosomet. Desuden bruger genkortlægning fysiske kortlægningsmetoder under kortlægningsprocessen.
Figur 01: Genkortlægning
Genkortlægning kan hjælpe med at finde kromosomafvigelser. Derfor fungerer det genetiske kort som et diagnostisk værktøj til at opdage tilstande som Downs syndrom og Turners syndrom osv. Karyotyping er en teknik, der kan bruges til at generere et genetisk kort. Farvning er en vigtig teknik til at generere et genetisk kort, hvor pletter som ethidiumbromid, acridin orange og Giemsa bruges. Genkortlægning kan også generere koblingskort, hvor identifikation af placeringen af de forbundne gener finder sted.
Hvad er gensekvensering?
Gensekventering er den teknik, der bruges til at identificere og udlede genets præcise baseparsekvens. Således kan man gennem gensekventering udlede rækkefølgen af adenin-, guanin-, thymin- og cytosinbaser i en sekvens. Den første hel-genom-sekventering fandt sted i mikroorganismer. Det menneskelige genom-sekventeringsprojekt var et af vendepunkterne i molekylærbiologiens historie. På nuværende tidspunkt spiller gensekventering en vigtig rolle inden for industri og medicinske områder. Dette bekræfter præcist tilstedeværelsen af et bestemt gen i genomet.
Figur 02: Gensekvensering
Der er forskellige teknikker til at sekvensere et gen. Maxam og Gilbert var pionererne for at introducere en kemisk metode til at sekvensere gener eller DNA. Imidlertid fører brugen af potentielt farlige kemikalier til, at den kemiske sekventeringsteknik opgives. Senere introducerede Sanger en sekventeringsteknik, der ikke brugte nogen farlige kemikalier. Men på nuværende tidspunkt spiller automatiseret sekventering og næste generations sekventering vigtige roller i at udlede sekvensen af et bestemt gen.
Hvad er lighederne mellem genkortlægning og gensekvensering?
- Begge teknikker spiller vigtige roller i genetisk diagnostik.
- Disse teknikker har evnen til at bekræfte tilstedeværelsen af gener i genomet.
- Teknikker såsom polymerasekædereaktion kan bruges i begge processer.
Hvad er forskellen mellem genkortlægning og gensekventering?
Nøgleforskellen mellem genkortlægning og gensekventering er den information, de to teknikker genererer. Genkortlægning giver information om placeringen af et bestemt gen i et kromosom, mens gensekventering genererer information om sekvensen af basepar af et bestemt gen. Imidlertid spiller begge teknikker en rolle i karakteriseringen af et gen. Tiden og omkostningerne til færdiggørelsen af de to teknikker er således forskellige.
Nedenstående infografik opsummerer forskellen mellem genkortlægning og gensekventering.
Opsummering – Genkortlægning vs gensekvensering
Genkortlægning og gensekventering er to teknikker, der hjælper med at karakterisere et gen. Mens et genkort gør det muligt at lokalisere genet, giver gensekvensen de biokemiske data for det pågældende gen. Genkortlægning og gensekventering er meget vigtige i genetiske undersøgelser og genetisk diagnostik. Desuden er begge teknikker nu automatiseret for at sikre, at teknikkerne er hurtige og nøjagtige. Den information, der genereres gennem genkortlægning og gensekventering, bruges i nedstrømsprocesser under molekylær diagnostik.
