Nøgleforskellen mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig terminering er, at i Rho-afhængig terminering binder Rho-faktor til transkriptet og afslutter transskriptionen ved at bryde hydrogenbindinger mellem skabelonen og transskriptionen, mens Rho-uafhængig terminering afslutter transkriptionen producerer en hårnålesløjfestruktur og derefter U rig region i transskriptionen.
Transkription er et af de to stadier af genekspression. Det er den proces, der producerer en mRNA-sekvens ud fra den genetiske information, der er gemt i genets DNA-sekvens. Transskription foregår via tre trin: initiering, forlængelse og afslutning. RNA-polymerase-enzym binder til genets promotorsekvens og begynder at katalysere syntesen af RNA-strengen. Indtil terminatorsekvensen er fundet, tilføjer RNA-polymerase nukleotider og bygger RNA-strengen. Hos prokaryoter sker terminering gennem to store termineringsstrategier: Rho-afhængig terminering og Rho-uafhængig terminering. Rho-faktor er et protein, som har helicaseaktivitet.
Hvad er Rho-afhængig opsigelse?
Rho-afhængig terminering er en af de to typer transkriptionstermineringsstrategier, der forekommer i prokaryoter. Rho-faktor er et protein, som har helicaseaktivitet.
Figur 01: Rho-afhængig afslutning
Rho-protein binder til RNA-transkriptet og bevæger sig langs RNA-polymerasen i 5'-3'-retningen, hvilket fremmer dissociationen af hydrogenbindinger mellem DNA-skabelonen og RNA-transkriptet. Når Rho-faktor når transkriptionsboblen, trækker den DNA/RNA-hybrid fra hinanden og frigiver transkriptet fra transkriptionsboblen. Når dette sker, afslutter det transskriptionen.
Hvad er Rho uafhængig opsigelse?
Rho-uafhængig terminering er den anden strategi, der afslutter prokaryot transkription. Norm alt har en terminatorregion en omvendt gentagelsessekvens. Umiddelbart efter den omvendte gentagelsessekvens er der en adeninrig region (AAAA). Når RNA-polymerase bevæger sig fremad, producerer den en mRNA-sekvens. Da de to regioner er komplementære i den omvendte gentagelsessekvensregion, danner den en hårnålesløjfestruktur på grund af hydrogenbinding. Næste region bliver den U-rige region. Hårnålestrukturen standser RNA-polymeraseaktiviteten.
Figur 02: Rho Uafhængig opsigelse
Yderligere er der i de U-rige regioner svage interaktioner mellem U-baser af transskription og A-baser i skabelonen. Disse svage Adenin-Uracil-bindinger destabiliserer DNA-skabelonen og RNA-transkriptet og adskiller hinanden. I sidste ende frigør transskription fra transskriptionsstedet.
Hvad er lighederne mellem Rho Dependent og Rho Uafhængig opsigelse?
- Rho-afhængig og Rho-uafhængig terminering er to vigtige termineringsstrategier, der findes i prokaryoter.
- Begge former frigiver transkript fra DNA-skabelonen for at afslutte transskriptionen.
Hvad er forskellen mellem Rho Dependent og Rho Uafhængig opsigelse?
Rho-afhængig terminering medieres af et Rho-protein, mens Rho-uafhængig terminering sker via dannelsen af en hårnålesløjfestruktur. Så dette er den vigtigste forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse. Desuden udnytter Rho-protein ATP-energi, mens Rho-uafhængig afslutning ikke involverer Rho-protein og ikke udnytter ATP-energi. Derfor er dette også en væsentlig forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse.
Nedenstående infografik viser flere sammenligninger relateret til forskellen mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse.
Oversigt – Rho Dependent vs Rho Uafhængig opsigelse
Rho-afhængig og Rho-uafhængig terminering er de to vigtigste transkriptionstermineringsmekanismer, der forekommer i prokaryoter. Et Rho-protein er ansvarlig for transkriptionstermineringen i Rho-afhængig terminering. I modsætning hertil sker Rho uafhængig afslutning via en dannelse af hårnålesløjfestrukturen. Så dette er den vigtigste forskel mellem Rho-afhængig og Rho-uafhængig opsigelse.
