Nøgleforskellen mellem sigma-faktor og rho-faktor er, at sigma-faktor er et protein, der er nødvendigt for initiering af transkription i bakterier, mens rho-faktor er et protein, der er nødvendigt til terminering af transkription i bakterier.
Sigma-faktor og rho-faktor er to vigtige faktorer for bakteriel transkription. Bakteriel transkription er en proces, hvor et stykke bakterielt DNA kopieres ind i en nyfremstillet streng af mRNA (messenger RNA). Denne proces katalyseres af et enzym kendt som RNA-polymerase. Bakterier er stærkt afhængige af transkription og oversættelse for at reagere på deres miljø korrekt. Den bakterielle RNA-polymerase består af en kerne og en holoenzymstruktur. Kernen indeholder underenhederne β, β′, α og 2ω, mens holoenzymet indeholder sigmafaktoren. Desuden er en hjælpefaktor til RNA-polymerase kendt som rho-faktoren også meget vigtig for bakteriel transkription.
Hvad er Sigma Factor?
Sigma-faktor eller specificitetsfaktor er et protein, der er nødvendigt for initiering af transkription i bakterier. Det er en bakteriel transkriptionsinitieringsfaktor. Denne faktor muliggør binding af RNA-polymeraseenzym til en specifik DNA-region kaldet promotorregionen under transkription. Sigma-faktor er norm alt homolog med archaeal transkriptionsfaktor B og til eukaryotisk transkriptionsfaktor TF11B. Desuden varierer den specifikke sigma-faktor for et givet gen afhængigt af genet og miljøsignaler. Promotorerne selekteres af RNA-polymerase afhængigt af sigma-faktoren forbundet med den.
Figur 01: Sigma Factor
Sigmafaktoren kan også findes i planters kloroplast som en del af den plastid-kodede polymerase (PEP). Sigma-faktoren og RNA-polymerase er helt kendt som RNA-polymerase-holoenzym. Molekylvægten af sigma-faktoren er omkring 70 kDa. Efter initiering af transkription dissocierer sigmafaktoren fra komplekset. Derefter fortsætter RNA-polymerasen forlængelsen, indtil transkriptionen afsluttes.
Hvad er Rho-faktor?
Rho-faktor er et prokaryot protein, der er involveret i terminering af transkription. Rho-faktor binder norm alt til transkriptionsterminatorpausestedet. Dette sted er en eksponeret region af det enkeltstrengede RNA nær den åbne læseramme ved cytosinrige guaninfattige sekvenser. Det er et essentielt transkriptionsprotein i prokaryoter. I Escherichia coli er rho-faktoren ca. 274,6 kDa hexamer af identiske underenheder. Hver underenhed har et RNA-bindende domæne og et ATP-hydrolysedomæne. Desuden er rho-faktorens funktion helikaseaktivitet.
Figur 02: Rho-faktor
Rho-faktor binder til RNA-molekyle og bruger derefter sin ATPase-aktivitet til at give energi til at translokere RNA-molekyler. Rho-faktor udfører translokation, indtil den når RNA-DNA-spiralformede region, hvor den afvikler hybrid (RNA-DNA) dupleksstrukturen. Denne proces sætter RNA-polymerase på pause på termineringsstedet og afslutter transkriptionsprocessen.
Hvad er lighederne mellem Sigma-faktor og Rho-faktor?
- Sigma-faktor og rho-faktor er to vigtige faktorer for bakteriel transkription.
- Begge er kun til stede i prokaryoter.
- De er proteiner, der består af aminosyrer.
- Begge er nukleinsyrebindende proteiner.
- Prokaryoter er stærkt afhængige af disse faktorer for at generere mRNA, der kan lave ejendommelige proteiner og hjælpe dem med at reagere specifikt på deres miljø.
Hvad er forskellen mellem Sigma-faktor og Rho-faktor?
Sigma-faktor er et protein, der er nødvendigt for initiering af transkription i bakterier, mens rho-faktor er et protein, der er nødvendigt for terminering af transkription i bakterier. Så dette er den vigtigste forskel mellem sigma-faktor og rho-faktor. Endvidere er sigma-faktoren et DNA-bindende protein, mens rho-faktoren er et RNA-bindende protein.
Nedenstående infografik præsenterer forskellene mellem sigma-faktor og rho-faktor i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkription er den proces, hvor informationen i DNA kopieres til et nyt molekyle kaldet mRNA (messenger RNA). Dette m-RNA er i sidste ende involveret i at producere et specifikt protein. Sigma-faktor og rho-faktor er to vigtige faktorer for bakteriel transkription. De er proteiner. Sigma-faktor deltager i initieringen af transkription i bakterier. Rho-faktor er ansvarlig for terminering af transkription i bakterier. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem sigma-faktor og rho-faktor.
