Nøgleforskellen mellem aktivt sted og bindingssted er, at et aktivt sted hjælper med katalysen af en kemisk reaktion, mens et bindingssted hjælper med bindingen af en ligand til et stort molekyle.
Et bindingssted er en region på et protein, DNA eller RNA, som en ligand kan binde til. Enzymer er proteiner. Et aktivt sted er et område på et enzym, som substraterne kan binde til for at gennemgå en kemisk reaktion. Denne specifikke region har også et bindingssted sammen med et katalytisk sted. Derfor hjælper bindingssteder kun med bindingen af en ligand til et stort molekyle, mens aktive steder hjælper både med bindingen af en ligand til et stort molekyle, mens det lader den gennemgå en katalyseret kemisk reaktion.
Hvad er et aktivt websted?
Det aktive sted er en region på et enzym, som substraterne for en kemisk reaktion binder til for at gennemgå en katalyseret kemisk reaktion. denne region består af to underregioner som et bindingssted og et katalytisk sted. Bindingsstedet indeholder nogle rester, der kan hjælpe bindingen af substratet (reaktanterne) til enzymet. Det katalytiske sted hjælper med at katalysere den kemiske reaktion. Desuden er denne region meget lille sammenlignet med hele enzymets volumen; ca. 10-20 % af hele enzymets volumen.
Figur 01: Bindingsstedet og det katalytiske sted for et aktivt websted
Som regel indeholder det aktive websted 3-4 aminosyrer. resten af aminosyrerne i enzymet, der er involveret i at opretholde enzymets tertiære struktur. Endnu vigtigere er det, at et aktivt websted har et specifikt design, som kan passe med et specifikt substrat. Derfor reagerer disse enzymer kun med bestemte substrater. Men nogle gange har enzymer brug for cofaktorer for deres funktion. Hovedfunktionen af det aktive sted er at reducere aktiveringsenergien af en kemisk reaktion for derved at øge reaktionshastigheden.
Hvad er bindende websted?
Bindingssted er en region på et protein, DNA eller RNA, som ligander kan binde til. Der kan liganden danne en kemisk binding med dette sted. Disse regioner viser specificitet; en bestemt ligand vil binde til et bestemt bindingssted. Derfor er dette sted et mål for de typer ligander, der kan binde med et molekyle.
Yderligere bruger vi ofte disse regioner til funktionel karakterisering af biomolekyler. For eksempel kan vi karakterisere funktionaliteten af et aktivt sted gennem dets bindingssted. I tilfælde af DNA er den specifikke type bindingssted desuden transkriptionsfaktorbindingsstedet, der er til stede på DNA'et.
Hvad er forskellen mellem aktivt websted og bindende websted?
Aktivt sted er en region på et enzym, som substraterne for en kemisk reaktion binder til for at gennemgå en katalyseret kemisk reaktion, hvorimod bindingsstedet er en region på et protein, DNA eller RNA, som ligander kan binde til. Dette er den vigtigste forskel mellem aktivt sted og bindingssted. Desuden er de aktive steder til stede på enzymer, og de hjælper med at øge reaktionshastigheden for en bestemt kemisk reaktion ved at reducere aktiveringsenergibarrieren for den reaktion. Bindingssteder er på den anden side ansvarlige for bindingen af en specifik ligand til et bestemt molekyle.
Nedenstående infografik viser forskellen mellem aktivt site og bindingssted i tabelform.
Oversigt – aktivt websted vs bindende websted
Aktive steder er områder på enzymer, der kan øge reaktionshastigheden af en kemisk reaktion ved at reducere aktiveringsenergibarrieren for den reaktion. Et bindingssted er et hvilket som helst område, som en ligand kan binde til. Aktivt sted indeholder også et bindingssted. Forskellen mellem aktivt sted og bindingssteder ligger på eksistensen og funktionaliteten. Derfor er den vigtigste forskel mellem aktivt sted og bindingssted, at et aktivt sted hjælper med katalysen af en kemisk reaktion, mens et bindingssted hjælper med bindingen af en ligand til et stort molekyle.
