Nøgleforskellen mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering er, at ved replikativ transposition kopieres transposonen til en ny placering, mens transposonen flyttes til en ny placering ved klip og indsæt transposition.
Transposerbare elementer eller springgener er DNA-sekvenser, der kan ændre deres position i genomet. Dette omtales som gennemførelse. Transposition kan nogle gange skabe eller vende mutationer og ændre cellens genetiske identitet og genomstørrelse. Transposition blev opdaget af Barbara McClintock i 1983. Transponering kan foregå gennem to teknikker som duplikering og klip og indsæt.
Hvad er replikativ transponering?
Replikativ transposition er en type transponeringsmekanisme, der hjælper med transposonudskæring fra den oprindelige placering til en anden gennem replikeret eller duplikeret teknik. Denne mekanisme blev først fundet af James A Shapiro i 1979. I denne mekanisme bliver det transponerbare element duplikeret under transponeringsreaktionen, så den transponerende enhed er en kopi af det originale element. Desuden danner donor- og receptor-DNA-sekvenserne i denne mekanisme en karakteristisk mellemliggende "theta"-konfiguration kaldet Shapiro-mellemprodukt (kointegreret). Replikativ transposition er en karakteristisk retrotransposon. Denne mekanisme forekommer norm alt i klasse I-transposoner.
Figur 01: Replikativ transponering
Et godt eksempel på replikativ transposition kan observeres i E. coli TN3-transposon. TN3-transposon kan bevæge sig fra det oprindelige plasmid til et andet målplasmid gennem replikeret eller duplikeret teknik. Hele denne begivenhed medieres af to vigtige enzymer kaldet transposase og resolvase. Endvidere kan replikativ transposition observeres i både DNA-transposoner og retroposoner. Den bedst undersøgte transponerbare bakterielle virus er bakteriofagen Mu.
Hvad er klip og indsæt-transponering?
Klip og indsæt transposition er en type transponeringsmekanisme, der hjælper med transposonudskæring fra den oprindelige placering til en anden gennem klip og indsæt-teknikken. Denne mekanisme er også kendt som den konservative model for transponering. I denne ikke-replikative transposition finder udskæringen og integrationen af en transposon fra en genomisk placering til en anden sted uden at efterlade en kopi.
Figur 02: Klip og indsæt transposition
I denne mekanisme binder transposaseenzymet sig først til de terminale gentagelser, der norm alt er til stede i begge ender af transposonerne, og det danner derefter en struktur kaldet synaptisk kompleks (transpososom). Det synaptiske kompleks sp alter transposonet fra dets oprindelige genomiske placering og integrerer det i den nye målplacering. Derefter forlader transposaser fra begge ender af transposonen. Når først transposaseenzymet forlader transposonet, udfyldes hullerne af værtspolymeraseenzymet. Dette muliggør fuldstændig sammenføjning af transposonet til den nye genomiske placering. Denne mekanisme forekommer norm alt i klasse II-transposoner. Desuden er TN5 bakterielle transposoner et velkendt eksempel, der viser en konservativ eller klip og indsæt transpositionsmekanisme.
Hvad er lighederne mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering?
- Replikativ transponering og klip og indsæt transponering er to typer transponeringsmekanismer.
- I begge mekanismer flytter de transponerbare elementer fra en genomisk placering til en anden ny genomisk placering.
- Begge mekanismer kan skabe eller vende mutationer og ændre cellens genetiske identitet.
- Bakterielle transposoner viser begge mekanismer.
- De er ekstremt vigtige begivenheder for evolutionen.
Hvad er forskellen mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering?
Replikativ transponering er en type transponeringsmekanisme, hvor transposonen kopieres til en ny placering, mens klip og indsæt transposition er en type transponeringsmekanisme, hvor transposonen flyttes til en ny placering. Dette er således den vigtigste forskel mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering. Endvidere forekommer replikativ transponering norm alt i klasse I-transposoner, mens klip- og indsæt-transposition norm alt forekommer i klasse II-transposoner.
Nedenstående infografik præsenterer forskellene mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering i tabelform til sammenligning side om side.
Opsummering – Replikativ transposition vs klip og indsæt transposition
Replikativ transponering og klip og indsæt transponering er to typer transponeringsmekanismer. Replikativ transposition er en type transpositionsmekanisme, hvor transposonet kopieres til en ny placering, mens klip og indsæt transposition er en type transpositionsmekanisme, hvor transposonen flyttes til en ny placering. Så dette opsummerer forskellen mellem replikativ transponering og klip og indsæt transponering.
