Nøgleforskellen mellem serin og tyrosinrekombinase er, at i serinrekombinase er serin den nukleofile aminosyre, der bruges af enzymet til at angribe DNA under stedspecifik rekombination, mens tyrosin i tyrosinrekombinase er den nukleofile aminosyre, der anvendes. af enzymet til at angribe DNA'et under stedspecifik rekombination.
Sitespecifik rekombination (konservativ stedspecifik rekombination) er en type genetisk rekombinationsteknik, hvor DNA-strengudveksling finder sted mellem segmenter med en vis grad af sekvenshomologi. Stedspecifikke rekombinaser regulerer den stedspecifikke rekombinationsproces. Disse enzymer er grupperet i to familier som serinrekombinasefamilie og tyrosinrekombinasefamilie. Navnene kommer fra den konserverede nukleofile aminosyrerest, der er til stede i de to ovennævnte klasser af rekombinaser, som bruges til at angribe DNA, og som bliver kovalent forbundet med det under strengudveksling i stedspecifik rekombination.
Hvad er Serine Recombinase?
I den stedspecifikke rekombinationsmetode skæres to korte DNA-sekvenser ('målsteder') på specifikke punkter i begge strenge, og de afskårne ender sammenføjes igen med nye partnere. Stedspecifikke rekombinationsteknologier er genomiske værktøjer inden for genteknologi, der er afhængige af rekombinaseenzymer til at erstatte målsektionen af DNA'et. Mange stedspecifikke rekombinationssystemer har vist sig at udføre disse DNA-omlejringer til forskellige formål. Men alle disse rekombinaseenzymer tilhører to familier. Serinrekombinase er en af dem. De kan mediere op til tre typer af DNA-omlejringer: integration, excision og inversion.
Figur 01: Serine Recombinase
De stedspecifikke rekombinaser som serin-rekombinase udfører DNA-omlejring ved at genkende og binde til en kort DNA-sekvens (målsted), hvor de sp alter DNA-rygraden. Senere sker udvekslingen af to DNA-spiraler, og genforening af DNA-strenge finder sted. I serinrekombinase er serin den aminosyre, der bruges af enzymet til at angribe DNA'et under stedspecifik rekombination. Under DNA-sp altning dannes protein-DNA-bindingen via en transesterificeringsreaktion. Phosphodiesterbindingen erstattes af phosphoserinbindingen mellem 5'phosphatgruppen ved sp altningsstedet og hydroxylgruppen i en konserveret serinrest. Den nye binding lagrer energi, der bruges på at sp alte DNA på målstedet. Denne energi bruges senere til at genføje DNA'et til den tilsvarende deoxyribose-hydroxylgruppe på det andet sted. Eksempler på serin-rekombinaser er serin-resolvaser/invertaser og serin-integraser.
Hvad er Tyrosin Recombinase?
Tyrosinrekombinase er den anden enzymklasse, der regulerer konservativ stedspecifik rekombination. Som tidligere beskrevet udfører tyrosinrekombinase også DNA-omlejring på samme måde ved at genkende og binde til en kort DNA-sekvens (målsted), hvor de sp alter DNA-rygraden. Senere finder udskiftning af to DNA-spiraler og genforening af DNA-strenge sted.
Figur 02: Tyrosin Recombinase
Men i tyrosinrekombinase er tyrosin den aminosyre, som enzymet bruger til at angribe DNA'et under stedspecifik rekombination. Det fælles træk ved denne klasse er en konserveret nukleofil tyrosinrest, der angriber det sp altelige DNA-phosphat for at danne en 3'-phosphotyrosinbinding. Tyrosin rekombinaser (A1) og tyrosin integraser (A2) er de fremtrædende enzymgrupper i tyrosin rekombinase enzymfamilien.
Hvad er lighederne mellem serin og tyrosinrekombinase?
- De er en klasse af rekombinase-enzymer.
- Begge regulerer stedspecifik rekombination.
- De er proteiner.
- Den grundlæggende kemiske reaktion er den samme for begge.
- Begge katalyserer transesterificeringsreaktioner.
Hvad er forskellen mellem serin og tyrosin rekombinase?
I serinrekombinase er serin den nukleofile aminosyre, der bruges af enzymet til at angribe DNA'et under stedspecifik rekombination. På den anden side, i tyrosinrekombinase, er tyrosin den nukleofile aminosyre, der bruges af enzymet til at angribe DNA'et under stedspecifik rekombination. Så dette er den vigtigste forskel mellem serin og tyrosin rekombinase. Det fælles træk ved serinrekombinase er, at det danner en phosphoserinbinding med DNA, mens tyrosinrekombinase danner en phosphotyrosinbinding med DNA under den stedspecifikke rekombinationsproces.
Nedenstående infografik viser forskellene mellem serin og tyrosin rekombinase i tabelform.
-
Forskel mellem serin og tyrosin rekombinase i tabelform
Opsummering – Serine vs Tyrosin Recombinase
Rekombination kan forekomme mellem lignende DNA-molekyler som i homolog-rekombination eller uens molekyler som i ikke-homolog-rekombination. Stedspecifik rekombination er en type genetisk rekombination, hvor DNA-strengudveksling finder sted mellem segmenter med mindst en vis grad af sekvenshomologi. Det katalyseres af rekombinaser. De fleste rekombinaser er grupperet i to familier: serinrekombinase og tyrosinrekombinase. Serinrekombinase bruger serin som den nukleofile aminosyre til at angribe DNA'et under den stedspecifikke rekombinationsproces. Tyrosin rekombinase bruger tyrosin som den nukleofile aminosyre til at angribe DNA'et under den stedspecifikke rekombinationsproces. Derfor er dette den vigtigste forskel mellem serin og tyrosin rekombinase.
