Nøgleforskellen mellem VNTR og probe er, at VNTR er en kort nukleotidsekvens, der forekommer som en tandemgentagelse i genomet, mens en probe er en kunstigt syntetiseret kort sekvens af DNA eller RNA, der kunne mærkes radioaktivt.
VNTR står for variabel nummer tandem repeat. Det er en kort nukleotidsekvens organiseret i tandemgentagelser i genomet. VNTR'er forekommer naturligt i vores genom. En probe er en kunstigt syntetiseret kort DNA- eller RNA-sekvens. Både probe og VNTR er nukleinsyrer eller korte nukleotidsekvenser. De har enorm brug i forskellige molekylærbiologiske teknikker, hovedsageligt i retsmedicinske undersøgelser. VNTR og sonde deler nogle ligheder såvel som forskelle. Derfor forsøger artiklen at fremhæve forskellen mellem VNTR og sonde.
Hvad er en VNTR?
VNTR er en kort nukleotidsekvens, der eksisterer som en tandemgentagelse i vores genom. VNTR'er er til stede i mange kromosomer. Ydermere adskiller VNTR'er sig blandt forskellige individer fra længderne, da antallet af gentagelser er forskelligt i VNTR'er for forskellige mennesker. Dybest set skyldes det alleler, der er arvet fra deres forældre. Derfor bruger vi hovedsageligt VNTR'er til forældres identifikation (arv) eller til personlige formål. På samme måde er det også muligt at bruge dem i genetik, retsmedicin, biologisk forskning og DNA-fingeraftryk. Derfor er VNTR et vigtigt værktøj inden for molekylærbiologi.
Figur 01: VNTR
I nedarvning analyserer vi VNTR-data ved hjælp af to grundlæggende principper: arvematching og identitetsmatchning. Under arvematchning skal individet have en matchende allel til hver forælder. Under identitetsmatchning skal begge VNTR-alleler være til stede på en specifik placering af genomet.
Hvad er en sonde?
I forbindelse med molekylærbiologi er en probe et kunstigt syntetiseret DNA- eller RNA-fragment med en længde på 100 til 1000 baser. Vi kan radioaktivt mærke disse sonder. Derfor bruger vi dem til at detektere målnukleotidsekvenser, der er komplementære til sekvensen af proben. Når vi tilføjer prober til prøven, finder hybridisering sted med de komplementære sekvenser eller målsekvenser og gør det nemt for os at identificere målsekvenserne. Da sonder bærer radioaktivitet, kan vi nemt opdage dem.
Figur 02: Probe
Inden for retsmedicin bruger vi sædvanligvis prober i DNA-profileringsteknikker, såsom påvisning af korte tandem-gentagelsesregioner, restriktionsfragmentlængdepolymorfier og DNA-fingeraftryk.
Hvad er lighederne mellem VNTR og sonde?
- Nukleinsyrer er byggestenene i VNTR og Probe.
- Vi bruger dem i genidentifikationsprocesser.
- De to deres længder er også variable.
- De er vigtige værktøjer i retsmedicinske undersøgelser, DNA-fingeraftryk, genetik osv.
Hvad er forskellen mellem VNTR og sonde?
VNTR er en region af genomet organiseret som tandem-gentagelser, mens en probe er en kort DNA- eller RNA-sekvens, der er syntetiseret kunstigt for at detektere målsekvenser i en prøve. Så dette er den vigtigste forskel mellem VNTR og sonde. En vigtig forskel mellem VNTR og sonde er også, at i modsætning til VNTR'er kan vi radioaktivt mærke proberne.
Ydermere udfører VNTR'er for det meste forældreidentifikationer, mens prober hjælper med at detektere målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver, der er komplementære til probens sekvens. Derfor er dette også en væsentlig forskel mellem VNTR og sonde.
Den følgende infografik præsenterer flere oplysninger om forskellen mellem VNTR og sonde.
Oversigt – VNTR vs Probe
Den almindelige brug af VNTR og sonde er i molekylære analyseteknikker såsom retsmedicinske undersøgelser og DNA-fingeraftryk. Begge består af variable længder. Den vigtigste forskel mellem VNTR og probe er imidlertid, at en VNTR er en region af genomet arrangeret med tandemgentagelser, mens en probe er et fragment af DNA eller RNA, der kunne mærkes radioaktivt. Desuden er VNTR'er til stede i genomet. Men prober syntetiseres kunstigt og kunne mærkes radioaktivt for at detektere målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver, der er komplementære til sekvensen i proben. Dette er således opsummeringen af forskellen mellem VNTR og sonde.
