Nøgleforskellen mellem LAMP og PCR-test er, at LAMP udføres ved konstant temperatur (60-650C) for at producere kopier af DNA gennem amplifikation, mens PCR udføres ved at bruge en række temperaturændringer til at producere kopier af DNA gennem amplifikation.
LAMP og PCR er begge in vitro amplifikationsteknikker, der bruges til at producere tusindvis af kopier af DNA. Mængden af DNA produceret i LAMP er meget højere end mængden produceret i PCR-teknikker såsom RT-PCR. LAMP er en nyere teknik sammenlignet med PCR-teknikken. Men det er teknisk enkelt og nemt for en uddannet videnskabsmand at udføre under laboratorieforhold. Dette gør det til en potentielt nyttig teknik til påvisning af COVID-19. RT-PCR er dog den nuværende standardtest for COVID-19. Selvom disse teknikker er velkendte for forskere og klinikere med en baggrund inden for DNA-amplifikation, kan de stadig være relativt ukendte for et bredere samfund.
Hvad er LAMPE-test?
Sløjfemedieret isotermisk amplifikation (LAMP) til COVID-19-assays starter med en samling af prøver fra næsen eller halsen ved hjælp af en vatpind. Prøverne kan også indsamles ved hjælp af andre metoder, såsom slim fra hård hoste. Ligesom PCR-teknik såsom RT-PCR, omdannes det virale RNA i prøven først til DNA, hvilket gør det muligt at kopiere det. LAMP-reaktionen udføres ved konstant temperatur (60-650C).
Amplifikationen af vir alt DNA, der inkorporerer LAMP-teknologi og reagenser, kan detekteres, når reaktionsblandingen bliver uklar på grund af produktionen af "magnesiumpyrophosphat". Denne uklarhed muliggør let diagnosticering af COVID-19 af videnskabsmænd og klinikere. Nøjagtigheden af testresultater kan forbedres ved at bruge specielle fluorescerende farvestoffer eller farveskiftende farvestoffer i reaktionsblandingen. Disse farvestoffer interagerer med vir alt DNA, og intensiteten af lyset eller farveændringen kan måles for at give det antal virale RNA-molekyler, der var omtrent det, der oprindeligt var i prøven.
Hvad er PCR-test?
PCR er en meget almindelig videnskabelig teknik, som har været meget brugt i forskning og medicin i 20-30 år til at påvise DNA. PCR-test bruges direkte til at påvise et antigen ved at påvise vir alt RNA. Generelt er vir alt RNA til stede i kroppen, før man opdager antistoffer eller får symptomerne på sygdommen. Derfor kan en PCR-test fortælle, om nogen har viruset tidligt eller ej. I øjeblikket er PCR standardtesten til påvisning af COVID-19. Der er forskellige typer af PCR-teknikker såsom real-time PCR, indlejret PCR, multiplex PCR, hot start PCR og langdistance PCR osv. PCR bruger en række temperaturændringer til at producere kopier af DNA gennem amplifikation.
RT-PCR er en speciel version af PCR-teknikken. Det bruges, når RNA påvises. Det bruges nu til at teste COVID-19. RT-PCR er en ret følsom og pålidelig teknik. I RT-PCR, når en prøve er indsamlet, bruges kemikalier til at fjerne uønskede proteiner, fedtstoffer og andre molekyler, hvilket efterlader RNA'et. Testkittets enzymer omdanner først RNA til DNA, som derefter amplificerer vir alt DNA for at påvise virussen. Fluorescerende farvestoffer bruges typisk til at binde til det amplificerede DNA og producere lys. Dette kan læses af maskinen for at frembringe testresultatet.
Hvad er lighederne mellem LAMP og PCR-test?
- De er forstærkningsteknikker.
- Begge producerer kopieret DNA.
- De er meget følsomme og pålidelige teknikker end immunteknikker som antistofdetektion.
- De bruges begge til COVID-19-test.
Hvad er forskellen mellem LAMP- og PCR-test?
Nøgleforskellen mellem LAMP- og PCR-test er, at i LAMP opnås forstærkning ved hjælp af en konstant temperatur (60-650C), mens i PCR, cyklus af temperaturer er påkrævet. Flere typer LAMPE-teknikker er tilgængelige i øjeblikket. Men de vigtigste for COVID-19-detektion er omvendt transkriptionsløkke-medieret isotermisk teknik (RT-LAMP) og transkript-medieret amplifikation (TMA). Desuden er forskellige typer PCR-teknikker også tilgængelige i klinisk praksis til sygdomsdiagnostik, såsom real-time PCR, RT-PCR, nestet PCR, multiplex PCR, hot-start PCR, lang rækkevidde PCR osv.
Nedenstående infografik viser forskellene mellem LAMP- og PCR-test i tabelform.
Opsummering – LAMPE vs PCR-test
Loop-medieret isotermisk amplifikation er en proces, der ligner PCR-tests såsom RT-PCR, men den producerer flere virale DNA-kopier ved en konstant temperatur. Polymerase-kædereaktionstest er i øjeblikket den mest almindelige og standardform for test i verden til sygdomsdiagnostik, såsom diagnosen COVID-19. Det ses som ret pålideligt. PCR bruger en række temperaturændringer til at producere kopier af DNA gennem amplifikation. Dette opsummerer således forskellen mellem LAMP og PCR-test.
